40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1241 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 
357 aa  721    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  55.37 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  45.22 
 
 
349 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  35.77 
 
 
355 aa  212  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  37.82 
 
 
358 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  34.94 
 
 
357 aa  205  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  36.28 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  35.43 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  34.58 
 
 
348 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  35.67 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  34.18 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  33.91 
 
 
352 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  34.16 
 
 
347 aa  176  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  29.67 
 
 
370 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  29.63 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  28.99 
 
 
371 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  30.95 
 
 
391 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  30.66 
 
 
391 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  30.66 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  29.97 
 
 
390 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  28.45 
 
 
383 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  28.86 
 
 
349 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.88 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  27.68 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.78 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.93 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  20.9 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  25.61 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  22.48 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.86 
 
 
346 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.22 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  23.68 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  22.48 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  23.46 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  22.19 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.84 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.89 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3074  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.51 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0254  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  29.48 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1017  hypothetical protein  23.25 
 
 
326 aa  43.5  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>