32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2049 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  100 
 
 		 325 aa  634    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  35.52 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  34.73 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  28.7 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  29.02 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  28.2 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  24.21 
 
 		 390 aa  96.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  27.68 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  22.9 
 
 		 391 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  23.19 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  23.19 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  25 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  25.53 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  25.88 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  26.38 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  25.43 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  27.33 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  26.53 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  25.48 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  23.34 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  30.95 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  27.41 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  21.02 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  21.32 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  25.14 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  22.67 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  26.35 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  23.92 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.17 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.19 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  21.93 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  21.54 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>