37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1279 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 
358 aa  709    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  67.15 
 
 
357 aa  480  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  65.24 
 
 
355 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  62.72 
 
 
348 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  64.71 
 
 
356 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  38 
 
 
357 aa  219  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  34.47 
 
 
360 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  36.75 
 
 
351 aa  199  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  36.29 
 
 
349 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  34.28 
 
 
351 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  34.1 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  33.99 
 
 
347 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  32.19 
 
 
351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  30.83 
 
 
371 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  31.87 
 
 
370 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  31.81 
 
 
375 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  30.2 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  29.91 
 
 
391 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  29.55 
 
 
383 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  29.91 
 
 
391 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  29.91 
 
 
391 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  27.48 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  30.95 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.42 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  25.75 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.83 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.57 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.6 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.51 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.18 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  21.83 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.89 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  20.11 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  20.11 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3074  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  19.92 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.11 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0254  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.81 
 
 
307 aa  43.1  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>