24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1688 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  100 
 
 
354 aa  688    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  31.49 
 
 
335 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  31.49 
 
 
335 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  32.95 
 
 
339 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  29.91 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0254  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  29.33 
 
 
307 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.49 
 
 
336 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  26.88 
 
 
383 aa  87  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  26.15 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  23.85 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.18 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  23.85 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  23.85 
 
 
391 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  23.95 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  26.97 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  24.73 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  25.14 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3074  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.68 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.89 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  24.62 
 
 
349 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  23.89 
 
 
358 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  23.43 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  22.16 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.38 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>