29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1451 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  100 
 
 
325 aa  634    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  61.8 
 
 
328 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  34.53 
 
 
325 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  29.87 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  27.99 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  28.57 
 
 
351 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  27.32 
 
 
355 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  28.65 
 
 
348 aa  89.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  27.81 
 
 
356 aa  89  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  27.68 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  26.38 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  26.84 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  27.83 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  26.29 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  25.79 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  27.15 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  25.15 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  21.88 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  22.94 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  24.14 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  23.82 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  22.65 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  22.65 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  24.46 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  22.54 
 
 
371 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  20.14 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.4 
 
 
336 aa  43.5  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  24.19 
 
 
375 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  26.04 
 
 
375 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>