36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1435 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 
357 aa  709    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  67.15 
 
 
358 aa  462  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  62.99 
 
 
355 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  63.91 
 
 
356 aa  411  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  59.65 
 
 
348 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  34.58 
 
 
357 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  33.52 
 
 
351 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  33.14 
 
 
360 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  35.83 
 
 
351 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  34.54 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  31.21 
 
 
352 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  31.39 
 
 
351 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  30.89 
 
 
371 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  29.69 
 
 
347 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  30.14 
 
 
370 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  28.32 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  28.77 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  27.17 
 
 
391 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  27.17 
 
 
391 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  27.17 
 
 
391 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  28.23 
 
 
375 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  27.64 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.57 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  26.38 
 
 
325 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.25 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.67 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.93 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  23.01 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  26.16 
 
 
375 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.62 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.79 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.65 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1107  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.02 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  22.64 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3074  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.2 
 
 
326 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.53 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>