37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0388 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 360 aa  729    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  54.42 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  42.99 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  36.47 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  38 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  33.33 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  34.47 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  33.14 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  35.41 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 348 aa  175  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  34.2 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  32.75 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  33.06 
 
 		 370 aa  156  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  31.99 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  31.97 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  29.43 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  27.09 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  27.3 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  27.01 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  27.01 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  27.3 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.57 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0522  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.71 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.1 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  25.22 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  25.22 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.84 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  19.94 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.58 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.92 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.3 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  22.86 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.59 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  24.93 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.54 
 
 		 344 aa  49.7  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1017  hypothetical protein  25.57 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>