26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2265 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 339 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  37.01 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  37.01 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  35.95 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  32.95 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3074  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  30.51 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0254  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  28.66 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  28.49 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.52 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  26.01 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  26.3 
 
 		 391 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  26.3 
 
 		 391 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  26.3 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  22.22 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  23.01 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  26.29 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  23.53 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  23.96 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  21.83 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  22.82 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  24.93 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  27.89 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  22.94 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  21.83 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.18 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  22.16 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>