34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3351 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  100 
 
 		 355 aa  701    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  85.13 
 
 		 356 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  63.94 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  62.99 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  65.24 
 
 		 358 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  35.71 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  36.52 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 360 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  33.71 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  35.84 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  32.11 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  31.07 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  29.41 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  30.59 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  30.88 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  30.55 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  30.09 
 
 		 391 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  30.09 
 
 		 391 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  30.09 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  30.47 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  29.18 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.63 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  29.02 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.76 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.43 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  26.51 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.72 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  22.85 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.54 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  27.89 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  24.14 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  22.38 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  24.14 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>