29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1247 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 370 aa  750    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  41.21 
 
 		 371 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  42.9 
 
 		 351 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  40.97 
 
 		 351 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  38.74 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  37.53 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  35.6 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  29.67 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  30.05 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  33.06 
 
 		 360 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  31.87 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  32.25 
 
 		 348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  30.14 
 
 		 357 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  30.59 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  29.56 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  23.24 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  22.97 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  23.24 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  26.82 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  21.14 
 
 		 390 aa  85.9  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  20.17 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.86 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.45 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.88 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  22.1 
 
 		 335 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  22.1 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  21.83 
 
 		 339 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  21.64 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>