31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1220 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 352 aa  712    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  56.82 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  55.68 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  55.97 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  52.89 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  35.22 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  35.6 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  36.31 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  37.32 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  35.21 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  34.3 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  34.1 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  31.21 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  32.94 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  32 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  26.93 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  26.93 
 
 		 391 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  26.93 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  26.36 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  26.22 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  25.8 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  25.07 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.02 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.79 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  23.28 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  22.99 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  19.66 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  23.96 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.38 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  22.82 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>