29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0285 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 351 aa  707    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  64.1 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  58.4 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  57.55 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  56.82 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  40.97 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  39.12 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  40.37 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  37.86 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  36.47 
 
 		 360 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  35.61 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  33.71 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  33.52 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  34.28 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  32.75 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  32.2 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  29.19 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  28.57 
 
 		 325 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  23.34 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  24.36 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  24.36 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  24.07 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  22.67 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.68 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  25.44 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.15 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.69 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1107  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  19.83 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.62 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>