28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2767 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 
371 aa  761    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  41.21 
 
 
370 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  39.73 
 
 
375 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  39.12 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  38.19 
 
 
351 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  35.22 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  36.39 
 
 
351 aa  235  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  35.26 
 
 
347 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  30.89 
 
 
357 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  31.72 
 
 
349 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  31.99 
 
 
360 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  30.83 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  29.41 
 
 
355 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  31.42 
 
 
356 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  28.65 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  28.95 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  28.84 
 
 
349 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  22.91 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  22.37 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  22.37 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  22.1 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  22.77 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.22 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.39 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  23.66 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.54 
 
 
325 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  21.81 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.16 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>