40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0296 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  98.72 
 
 
391 aa  765    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 
391 aa  774    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  88.97 
 
 
390 aa  699    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  98.72 
 
 
391 aa  764    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  69.31 
 
 
383 aa  510  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  30.09 
 
 
355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  28.15 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  26.93 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  29.91 
 
 
358 aa  126  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  27.17 
 
 
357 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.96 
 
 
362 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  30.92 
 
 
357 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  29.73 
 
 
349 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  28.06 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  27.07 
 
 
349 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.86 
 
 
397 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  25.07 
 
 
350 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  25.8 
 
 
334 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  25.5 
 
 
351 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.8 
 
 
336 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  27.3 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  26.3 
 
 
339 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  22.97 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  24.86 
 
 
347 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  21.53 
 
 
335 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  22.1 
 
 
371 aa  90.1  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  23.5 
 
 
351 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  21.25 
 
 
335 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  24.07 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.91 
 
 
346 aa  86.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  22.9 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1107  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.57 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.53 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  23.31 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  19.51 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.11 
 
 
344 aa  63.2  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.42 
 
 
325 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.56 
 
 
354 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3074  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.23 
 
 
326 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0254  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  20.54 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>