30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2347 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 347 aa  706    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  57.55 
 
 		 351 aa  408  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  56.94 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  57.43 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  52.89 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  37.53 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  39.08 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  35.26 
 
 		 371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  36.23 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  34.6 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  34.2 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  33.99 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  31.07 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  32.49 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  29.91 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  29.69 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  27.73 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  24.86 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  24.57 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  24.86 
 
 		 391 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  24.86 
 
 		 391 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  22.9 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  25.07 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.29 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.25 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.38 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  22.45 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  22.45 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.49 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.03 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>