26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1892 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 		 335 aa  676    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  99.4 
 
 		 335 aa  674    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  37.01 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  35.15 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  31.49 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0254  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  32.55 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.89 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  22.38 
 
 		 383 aa  95.9  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3074  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  25.52 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  21.53 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  21.25 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  20.96 
 
 		 391 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  20.96 
 
 		 391 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  21.32 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  20.56 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  25.22 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  23.21 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  22.99 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  22.45 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  22.49 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  22.1 
 
 		 370 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  22.76 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  22.69 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  19.37 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  21.34 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  24.14 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>