28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1772 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  100 
 
 		 397 aa  808    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  25.07 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.08 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  24.8 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  24.8 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  24.53 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  22.64 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  27.45 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  29.34 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1107  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.77 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  24.93 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  27.31 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  26.29 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  23.46 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  29.38 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  28.34 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.69 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  24.59 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  25.17 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  22.76 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  22.76 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  25.12 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0856  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  23.45 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1688  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  28.15 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.38 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  24 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  23.33 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0254  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.07 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>