23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3447 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  100 
 
 
346 aa  705    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.65 
 
 
350 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1107  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  27.68 
 
 
346 aa  99.4  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  25 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0522  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  24.32 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  26.18 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  25.91 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  26.18 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  22.57 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  23.1 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  23.63 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  24.51 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  19.94 
 
 
375 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1017  hypothetical protein  23.86 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  22.97 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  23.84 
 
 
349 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  22.54 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  21.94 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.01 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  22.48 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  22.38 
 
 
397 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  21.37 
 
 
362 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  23.53 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>