23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2088 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2088  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  100 
 
 		 375 aa  757    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.295713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.63 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0522  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  28.07 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  23.2 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  23.31 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  23.31 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  23.31 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  25.68 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  22.99 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  19.94 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  22.25 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1107  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.25 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  23.91 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  24.18 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  26.16 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  28.25 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3447  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  19.94 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  22.85 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  28.38 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  20.83 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  23.04 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.85 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  24.28 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.6298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>