182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1138 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1138  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  100 
 
 
273 aa  568  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.281449  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4269  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  43.56 
 
 
275 aa  234  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4445  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  43.23 
 
 
292 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.141802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3243  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.49 
 
 
296 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1095  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  44.4 
 
 
310 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0476  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.35 
 
 
259 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.622661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3451  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  44.27 
 
 
253 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000670941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0310  hypothetical protein  42.48 
 
 
261 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1200  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  41.22 
 
 
260 aa  214  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4284  hypothetical protein  42.7 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1336  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  42.97 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000105627 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0288  hypothetical protein  43.02 
 
 
260 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0650  hypothetical protein  43.02 
 
 
260 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0570  hypothetical protein  43.02 
 
 
260 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0320  hypothetical protein  41.57 
 
 
262 aa  208  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00988497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3194  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  42.44 
 
 
275 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02911  predicted dioxygenase  40.59 
 
 
271 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0662  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  40.59 
 
 
271 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02861  hypothetical protein  40.59 
 
 
271 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3622  hypothetical protein  41.33 
 
 
262 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0659  hypothetical protein  40.59 
 
 
271 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3216  hypothetical protein  40.59 
 
 
271 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000450029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4352  hypothetical protein  40.37 
 
 
271 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000625396  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2374  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.91 
 
 
284 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3503  hypothetical protein  40.37 
 
 
271 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3780  hypothetical protein  41.33 
 
 
262 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3336  hypothetical protein  40 
 
 
262 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1634  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  43.96 
 
 
284 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3370  hypothetical protein  40.98 
 
 
276 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3471  hypothetical protein  40 
 
 
271 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2339  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  42.28 
 
 
285 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.70741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3641  hypothetical protein  42.91 
 
 
289 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2686  hypothetical protein  39.02 
 
 
257 aa  201  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000991963  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3440  hypothetical protein  40.98 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2174  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.64 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804117  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3447  hypothetical protein  40.6 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3542  hypothetical protein  40.6 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3451  hypothetical protein  39.07 
 
 
262 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3375  hypothetical protein  40.23 
 
 
262 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1704  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.43 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0532  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  41.29 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0759  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.56 
 
 
282 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0765  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.18 
 
 
282 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0779  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.18 
 
 
282 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.548467 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0122  hypothetical protein  40.96 
 
 
289 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3123  hypothetical protein  39.54 
 
 
273 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1802  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  38.72 
 
 
265 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.411096  normal  0.0181188 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3853  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  39.54 
 
 
276 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4315  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  41.13 
 
 
257 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0933  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  42.91 
 
 
264 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0993  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  41.79 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00681173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0990  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  41.42 
 
 
264 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0679  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  36.94 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000247428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0752  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  37.64 
 
 
266 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3977  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  39.55 
 
 
283 aa  168  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2536  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  36.98 
 
 
263 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0358  hypothetical protein  39.18 
 
 
274 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39480  hypothetical protein  38.2 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00960347  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0406  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.77 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6127  putative extradiol ring-cleavage dioxygenase  38.78 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27390  hypothetical protein  38.95 
 
 
256 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0409  hypothetical protein  37.02 
 
 
257 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2316  hypothetical protein  38.2 
 
 
256 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1444  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  37.5 
 
 
255 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0945438  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0983  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  33.71 
 
 
263 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.793849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0687  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.82 
 
 
259 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.660455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1869  hypothetical protein  38.26 
 
 
264 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2171  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.91 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2634  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  37.55 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2953  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  34.72 
 
 
277 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66937  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2526  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  36.5 
 
 
255 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854892  normal  0.357361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2725  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  33.46 
 
 
261 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1559  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  36.56 
 
 
269 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3846  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  37.12 
 
 
255 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167723  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2416  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  34.22 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000936465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3482  oxidoreductase  31.95 
 
 
253 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.361889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3264  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  36.74 
 
 
259 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3594  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  33.33 
 
 
262 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1887  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  37.83 
 
 
275 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3607  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  32.7 
 
 
262 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3986  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  35.36 
 
 
255 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1928  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.98 
 
 
265 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.601302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0218  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  35.48 
 
 
267 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3618  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  32.7 
 
 
262 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0500  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  32.7 
 
 
262 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0432  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.34 
 
 
262 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0680  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  32.7 
 
 
262 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0976  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  32.7 
 
 
262 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1947  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  32.7 
 
 
262 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1897  oxidoreductase  31.58 
 
 
253 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1776  hypothetical protein  35.88 
 
 
255 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1723  oxidoreductase  31.58 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1859  oxidoreductase  31.58 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0432  putative 4,5-extradiol aromatic ring fission dioxygenase, DodA/LigB-like  31.32 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584853  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2767  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  34.96 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331215  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1717  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  31.2 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0478  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  33.21 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2599  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  33.21 
 
 
263 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0410  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  32.83 
 
 
263 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0506  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  33.21 
 
 
263 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>