205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2316 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2316  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27390  hypothetical protein  92.97 
 
 
256 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3986  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  71.88 
 
 
255 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1444  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  70.31 
 
 
255 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0945438  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3846  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  71.09 
 
 
255 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167723  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1869  hypothetical protein  71.48 
 
 
264 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2526  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  71.88 
 
 
255 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854892  normal  0.357361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3618  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  68.63 
 
 
255 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1478  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  68.36 
 
 
255 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.637793  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1776  hypothetical protein  65.62 
 
 
255 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0500  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  51.94 
 
 
262 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0680  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  51.94 
 
 
262 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0976  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  51.94 
 
 
262 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1947  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  51.94 
 
 
262 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0410  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  52.53 
 
 
263 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3607  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  51.94 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3593  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  52.53 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2599  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  52.53 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0506  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  52.53 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0432  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  54.05 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0478  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  52.53 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3618  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  51.94 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2892  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  52.92 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2634  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  50 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3594  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  51.94 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0436  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  51.75 
 
 
263 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387117  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2934  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  53.49 
 
 
262 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6127  putative extradiol ring-cleavage dioxygenase  51.74 
 
 
270 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3526  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  48.83 
 
 
261 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.083912  normal  0.191143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3741  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  48.07 
 
 
296 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0432  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  47.45 
 
 
313 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3418  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  48.07 
 
 
296 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1613  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  47.29 
 
 
278 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2725  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  47.66 
 
 
261 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3401  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.98 
 
 
296 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0432  putative 4,5-extradiol aromatic ring fission dioxygenase, DodA/LigB-like  47.27 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584853  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03046  4,5-dopa dioxygenase extradiol  52.02 
 
 
258 aa  221  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1765  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  45.88 
 
 
256 aa  221  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.304474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2305  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.9 
 
 
289 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2275  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  49.79 
 
 
265 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3239  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.1 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2793  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.85 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1860  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  45.8 
 
 
273 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201197  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2494  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  47.94 
 
 
312 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264128  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2536  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.46 
 
 
263 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2953  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  45.53 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66937  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0015  hypothetical protein  48.41 
 
 
296 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1443  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  49.81 
 
 
260 aa  207  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2101  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  46.9 
 
 
278 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1824  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  40.71 
 
 
261 aa  205  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.436879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0679  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  43.41 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000247428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1723  oxidoreductase  39.69 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1859  oxidoreductase  39.69 
 
 
253 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1897  oxidoreductase  39.69 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1944  oxidoreductase  39.69 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0358  hypothetical protein  45.56 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1700  oxidoreductase  39.84 
 
 
253 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2416  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39 
 
 
253 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000936465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1675  oxidoreductase  39.84 
 
 
253 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0492632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1860  oxidoreductase  39.69 
 
 
253 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1975  oxidoreductase  39.3 
 
 
253 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2574  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  41.41 
 
 
260 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1887  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  49.32 
 
 
275 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1717  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.69 
 
 
253 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3482  oxidoreductase  38.52 
 
 
253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.361889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1064  hypothetical protein  50.39 
 
 
268 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0687  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  49.57 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.660455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1456  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  38.67 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.216401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0209  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  44.92 
 
 
279 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39480  hypothetical protein  48.7 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00960347  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0409  hypothetical protein  44.27 
 
 
257 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0406  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  47.19 
 
 
254 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182951  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1928  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  47.37 
 
 
265 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.601302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0752  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  46.52 
 
 
266 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0752  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.08 
 
 
262 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1603  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  45.45 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000796384 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48032  predicted protein  39.92 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1819  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  45.38 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2767  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  47.23 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331215  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1909  hypothetical protein  39.18 
 
 
269 aa  171  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3542  hypothetical protein  41.73 
 
 
262 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3370  hypothetical protein  41.73 
 
 
276 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1725  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  38.49 
 
 
270 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1685  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  38.49 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3447  hypothetical protein  41.34 
 
 
262 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1691  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  38.91 
 
 
269 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.991273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3440  hypothetical protein  41.34 
 
 
262 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3375  hypothetical protein  41.34 
 
 
262 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0371  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.63 
 
 
263 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4352  hypothetical protein  40.78 
 
 
271 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000625396  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3231  Na+/H+ antiporter NhaA  41.92 
 
 
257 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.674705  normal  0.563929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1616  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  38.49 
 
 
269 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2867  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  41.95 
 
 
273 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592249  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0197  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.92 
 
 
265 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0354392  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1559  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  47.44 
 
 
269 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3451  hypothetical protein  41.18 
 
 
262 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02911  predicted dioxygenase  40.39 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0662  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  40.39 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02861  hypothetical protein  40.39 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3216  hypothetical protein  40.39 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000450029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>