187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3618 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3607  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  100 
 
 
262 aa  520  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3618  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  100 
 
 
262 aa  520  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0500  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  99.62 
 
 
262 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0680  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  99.62 
 
 
262 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0976  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  99.62 
 
 
262 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3594  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  99.62 
 
 
262 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1947  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  99.62 
 
 
262 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2934  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  93.51 
 
 
262 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0410  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  88.17 
 
 
263 aa  460  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2892  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  88.12 
 
 
263 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0436  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  87.4 
 
 
263 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387117  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3593  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  86.26 
 
 
263 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2599  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  87.02 
 
 
263 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0478  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  86.92 
 
 
263 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0506  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  87.02 
 
 
263 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0432  putative 4,5-extradiol aromatic ring fission dioxygenase, DodA/LigB-like  81.99 
 
 
261 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584853  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3526  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  80.46 
 
 
261 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.083912  normal  0.191143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2725  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  76.25 
 
 
261 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6127  putative extradiol ring-cleavage dioxygenase  51.34 
 
 
270 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2316  hypothetical protein  51.94 
 
 
256 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3986  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.3 
 
 
255 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0432  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  50 
 
 
262 aa  228  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2634  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  48.85 
 
 
258 aa  228  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2793  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.39 
 
 
264 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27390  hypothetical protein  48.64 
 
 
256 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1444  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  44.75 
 
 
255 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0945438  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2953  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  43.73 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66937  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03046  4,5-dopa dioxygenase extradiol  51.05 
 
 
258 aa  218  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1776  hypothetical protein  45.91 
 
 
255 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1613  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.42 
 
 
278 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1443  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  49.03 
 
 
260 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2526  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.3 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854892  normal  0.357361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1869  hypothetical protein  43.97 
 
 
264 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1478  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  44.4 
 
 
255 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.637793  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0687  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  47.69 
 
 
259 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.660455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1824  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  41.18 
 
 
261 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.436879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3846  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.19 
 
 
255 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167723  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3618  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  46.32 
 
 
255 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0358  hypothetical protein  43.85 
 
 
274 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3401  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  45.39 
 
 
296 aa  204  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3239  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  45.02 
 
 
295 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2275  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  42.92 
 
 
265 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.994054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1860  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.87 
 
 
273 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201197  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2574  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  46.35 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0679  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  40.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000247428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0409  hypothetical protein  47.23 
 
 
257 aa  198  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0209  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  46.48 
 
 
279 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2536  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  39.69 
 
 
263 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2101  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  46.04 
 
 
278 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39480  hypothetical protein  47.46 
 
 
258 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00960347  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3418  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  44.35 
 
 
296 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288553  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3741  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  43.95 
 
 
296 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1928  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  46.35 
 
 
265 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.601302  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0432  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  39.15 
 
 
313 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0752  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  40.23 
 
 
266 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3123  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3853  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  40 
 
 
276 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0752  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.54 
 
 
262 aa  185  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0288  hypothetical protein  38.89 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0650  hypothetical protein  38.89 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0570  hypothetical protein  38.89 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0406  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  45.12 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1887  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  43.73 
 
 
275 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2305  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  42.5 
 
 
289 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1765  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  38.13 
 
 
256 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.304474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2416  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.44 
 
 
253 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000936465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3471  hypothetical protein  39.22 
 
 
271 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4284  hypothetical protein  36.76 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3503  hypothetical protein  39.22 
 
 
271 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0310  hypothetical protein  37.55 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0320  hypothetical protein  37.55 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00988497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1603  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  43.4 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000796384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0476  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  36.58 
 
 
259 aa  178  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.622661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3336  hypothetical protein  38.82 
 
 
262 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3370  hypothetical protein  38.91 
 
 
276 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3451  hypothetical protein  38.98 
 
 
262 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3542  hypothetical protein  38.91 
 
 
262 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3169  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  43.48 
 
 
264 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3447  hypothetical protein  38.52 
 
 
262 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1819  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  45.76 
 
 
269 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3440  hypothetical protein  38.52 
 
 
262 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3375  hypothetical protein  38.52 
 
 
262 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3780  hypothetical protein  37.35 
 
 
262 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1064  hypothetical protein  45.77 
 
 
268 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1336  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  35.41 
 
 
259 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000105627 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02911  predicted dioxygenase  38.04 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0662  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  38.04 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1944  oxidoreductase  36.44 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1634  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  40.38 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1723  oxidoreductase  36.84 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1859  oxidoreductase  36.84 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4352  hypothetical protein  38.43 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000625396  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0659  hypothetical protein  38.04 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2494  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.86 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264128  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02861  hypothetical protein  38.04 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3216  hypothetical protein  38.04 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000450029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1700  oxidoreductase  36.03 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2171  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  42.08 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4315  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  44.59 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3194  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  41.98 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>