230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1380 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1682  bacterioferritin  100 
 
 		 147 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1380  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2643  bacterioferritin  54.2 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  51.16 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3194  ferritin Dps family protein  48.15 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0127  Ferritin Dps family protein  44.44 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0847  rubrerythrin  43.09 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  35.25 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  35.25 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  34.43 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  36.07 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  31.15 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  32.8 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  36.07 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  33.61 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  32.8 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  33.61 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  34.43 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  31.97 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  32 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  31.2 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  36.89 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  32.79 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  32.79 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  36.07 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  35.2 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  32.79 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  34.4 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  31.97 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  32.23 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  34.43 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  31.34 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  30.58 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  30.58 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  32.54 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  29.51 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  29.51 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  31.4 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  31.4 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  29.6 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  29.6 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  27.27 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  29.46 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  29.6 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  29.6 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  29.6 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  30.58 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  31.4 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  30.33 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  33.01 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  29.51 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  28.8 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  28.69 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  28.8 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0957  bacterioferritin  33.67 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.147551  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2530  bacterioferritin subunit 2  30.19 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  0.794719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  31.31 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  30.33 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  30.58 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  30.58 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  30.33 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  30 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  27.87 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  31.4 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1111  bacterioferritin subunit 2  31.37 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  29.59 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  29.51 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  28.8 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  30.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  28.69 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2873  bacterioferritin  33.73 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  27.87 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  27.87 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0946  bacterioferritin  29.41 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  27.87 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  33.64 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0944  bacterioferritin  30.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0982  bacterioferritin  30.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  28.69 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3430  bacterioferritin  30.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326699  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  33.33 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  30.95 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3555  bacterioferritin  30.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  33.33 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  35.29 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  28.69 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  33.33 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  33.33 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  32.71 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  28.93 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  28.69 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  28 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0932  bacterioferritin  30.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3358  bacterioferritin  30.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000472947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0948  bacterioferritin  29.41 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.811124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  28 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0990  bacterioferritin  30.84 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000039605  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  30.58 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  28 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>