30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0847 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0847  rubrerythrin  100 
 
 		 182 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3194  ferritin Dps family protein  36.3 
 
 		 148 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  37.04 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1682  bacterioferritin  41.41 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1380  Ferritin Dps family protein  43.09 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2643  bacterioferritin  32.03 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0127  Ferritin Dps family protein  31.11 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  28.68 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  28.68 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  27.91 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  27.13 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  27.13 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  25.58 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  24.81 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  26.36 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  29.41 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  25.58 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  25.58 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  25.58 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  24.81 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  27.01 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  27.82 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  26.53 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  25.58 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  24.48 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  24.03 
 
 		 165 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  26.42 
 
 		 159 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  25 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  22.15 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>