248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2643 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2643  bacterioferritin  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1682  bacterioferritin  55.22 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1380  Ferritin Dps family protein  54.2 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  51.47 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3194  ferritin Dps family protein  45.45 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0127  Ferritin Dps family protein  38.19 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  39.01 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  38.3 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  37.59 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  37.59 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  36.88 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  38.64 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  37.59 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  35.46 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  37.59 
 
 		 161 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  36.17 
 
 		 160 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  38.35 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  34.85 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  35.46 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  36.36 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  36.36 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  36.17 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  36.36 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  34.04 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  35.61 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  35.97 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  35.61 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  33.33 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  34.04 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  35.61 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  35.51 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  34.75 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  36.36 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  34.09 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  34.09 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  35.61 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  35.61 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  33.86 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  33.33 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  34.75 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  34.75 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  36.36 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  32.58 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  34.04 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  34.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  34.59 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  32.58 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  32.62 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  34.04 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  32.58 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  36.36 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  32.58 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  31.91 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  31.91 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  35.34 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  35.61 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  36.09 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  31.91 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  31.91 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  31.91 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  31.91 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  31.91 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  31.82 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  32.58 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  31.91 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  32.62 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  32.81 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  31.06 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  31.91 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  31.06 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  34.85 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  31.06 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  31.21 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  32.62 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  31.06 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>