239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3194 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3194  ferritin Dps family protein  100 
 
 
148 aa  300  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  61.59 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1682  bacterioferritin  48.92 
 
 
147 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1380  Ferritin Dps family protein  48.15 
 
 
141 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2643  bacterioferritin  45.45 
 
 
147 aa  130  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0127  Ferritin Dps family protein  37.84 
 
 
151 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  32.62 
 
 
160 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  32.62 
 
 
161 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0847  rubrerythrin  36.3 
 
 
182 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  31.85 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  32.62 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  32.62 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  31.11 
 
 
160 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  32.62 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  35.56 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  30.99 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  35.56 
 
 
161 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  36.3 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  35.56 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  32.59 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  35.16 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  32.59 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  32.59 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  32.59 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  27.78 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  30.14 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  34.07 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  27.46 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  34.56 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  34.07 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  28.77 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  31.11 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  29.58 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  30.56 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  31.62 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  29.79 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  31.11 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  29.63 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  29.08 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  28.68 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  27.41 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  28.89 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  28.91 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  33.09 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  32.17 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  29.69 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  29.37 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  29.37 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  30.23 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  30.34 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  26.76 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  29.69 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  30.34 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  30.07 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  26.57 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  26.57 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  26.57 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  28.87 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  29.41 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  26.9 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  29.58 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  31.13 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  25.69 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  27.94 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  31.11 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  24.48 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  29.37 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  25.93 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  25.93 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  28.36 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  27.66 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  25.52 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  27.66 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  27.66 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  27.66 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  27.66 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  27.66 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  27.66 
 
 
158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1111  bacterioferritin subunit 2  32.38 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  27.66 
 
 
180 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  28.87 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  27.21 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  32.65 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  35.79 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  26.95 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  26.95 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  26.95 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  28.17 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  26.95 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  26.95 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  26.24 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  25.17 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  26.95 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  25.93 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  25.19 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  28.15 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  25.19 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0957  bacterioferritin  31.48 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.147551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  26.47 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  26.47 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>