More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0704 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0704  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  100 
 
 
320 aa  653    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000206443  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0913  choline ABC transporter ATP binding protein  50.38 
 
 
305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
240 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1018  ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase component  50.41 
 
 
323 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.86191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
315 aa  261  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
315 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.28 
 
 
321 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 
315 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 
315 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 
315 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 
315 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 
315 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 
375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 
375 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.47 
 
 
376 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
243 aa  246  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
376 aa  245  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  48.37 
 
 
256 aa  243  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
351 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1516  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.72 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000189074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  49.37 
 
 
392 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0385  ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 
324 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  45.97 
 
 
324 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 
379 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0762  ABC transporter related  48.12 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.128148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  47.93 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0745  ABC transporter related  48.12 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 
378 aa  239  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.72 
 
 
370 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3087  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
435 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0730099  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  47.11 
 
 
378 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
252 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  49.37 
 
 
252 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  46.95 
 
 
334 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  46.95 
 
 
321 aa  235  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  45.95 
 
 
314 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
312 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
312 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 
380 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 
394 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  43.66 
 
 
318 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2557  ABC transporter related  49.59 
 
 
362 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000431635 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
408 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 
398 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
408 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  48.44 
 
 
312 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3636  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
288 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.90014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
369 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
370 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
395 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1406  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 
376 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515015  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.82 
 
 
371 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  46.41 
 
 
310 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  49.39 
 
 
367 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1208  ABC transporter related  47.93 
 
 
369 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 
364 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
382 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5600  ABC transporter-related protein  47.52 
 
 
370 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763793  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 
397 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0515  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 
398 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
322 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
381 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0501  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  42.27 
 
 
370 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  44.79 
 
 
314 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2842  ABC transporter related  47.93 
 
 
365 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00414619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  43.7 
 
 
386 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  44.57 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
328 aa  225  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30040  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  44.74 
 
 
282 aa  225  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
385 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
385 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  46.22 
 
 
384 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4966  ABC transporter related  44.61 
 
 
369 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
385 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5054  ABC transporter related  44.61 
 
 
369 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 
371 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5347  ABC transporter related  44.61 
 
 
369 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343425  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  42.01 
 
 
389 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4553  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
364 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6271  ABC transporter related  47.37 
 
 
360 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  46.3 
 
 
344 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
382 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  47.9 
 
 
312 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  47.9 
 
 
312 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  41.67 
 
 
393 aa  222  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1290  ABC transporter related  47.62 
 
 
326 aa  222  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19367  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
391 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  47.48 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  43.2 
 
 
382 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.96 
 
 
385 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  43.82 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  45.9 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  43.2 
 
 
382 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  43.2 
 
 
382 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  43.2 
 
 
382 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>