More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2730 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  46.18 
 
 
887 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0508  pyruvate phosphate dikinase  63.88 
 
 
848 aa  1017    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.83558  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3117  pyruvate phosphate dikinase  44.78 
 
 
888 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38254  normal  0.157801 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  46.42 
 
 
887 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  46.31 
 
 
887 aa  675    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0645  pyruvate phosphate dikinase  63.52 
 
 
852 aa  1016    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.211881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  42.74 
 
 
888 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  41.56 
 
 
883 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  44.91 
 
 
1028 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1859  pyruvate phosphate dikinase  63.88 
 
 
848 aa  1017    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  42.74 
 
 
888 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  43.09 
 
 
922 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2401  pyruvate phosphate dikinase  65.75 
 
 
862 aa  1063    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322611  normal  0.628675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0716  pyruvate phosphate dikinase  44.6 
 
 
899 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  43.79 
 
 
1004 aa  661    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  44.56 
 
 
887 aa  676    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 
845 aa  1698    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1409  pyruvate phosphate dikinase  42.97 
 
 
883 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000166258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  43.68 
 
 
991 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  41.39 
 
 
884 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  43.91 
 
 
1027 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  45.29 
 
 
937 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2309  pyruvate phosphate dikinase  64.29 
 
 
854 aa  1090    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0606667  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  44.71 
 
 
885 aa  661    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  44.85 
 
 
887 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  44.14 
 
 
898 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  43.79 
 
 
891 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  42.62 
 
 
890 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  44.79 
 
 
987 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2849  pyruvate phosphate dikinase  44.26 
 
 
891 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.543081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  42.15 
 
 
892 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  42.39 
 
 
896 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1102  pyruvate phosphate dikinase  45.46 
 
 
894 aa  697    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  43.27 
 
 
895 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0541  pyruvate phosphate dikinase  63.28 
 
 
853 aa  1019    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520973  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0717  pyruvate phosphate dikinase  44.68 
 
 
901 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681359  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0356  pyruvate, phosphate dikinase  39.36 
 
 
912 aa  642    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0662  pyruvate phosphate dikinase  44.05 
 
 
894 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  42.2 
 
 
886 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  44.66 
 
 
888 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  44.06 
 
 
895 aa  655    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  43.79 
 
 
889 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  46.06 
 
 
1008 aa  663    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  42.14 
 
 
877 aa  635  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  44.5 
 
 
886 aa  635  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  43.09 
 
 
892 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  41.86 
 
 
890 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0942  pyruvate, phosphate dikinase  43.67 
 
 
893 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1318  pyruvate phosphate dikinase  42.96 
 
 
889 aa  623  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  40.12 
 
 
876 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  40.12 
 
 
876 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  42 
 
 
885 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  41.06 
 
 
888 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  43.07 
 
 
886 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  39.79 
 
 
873 aa  621  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0657  pyruvate phosphate dikinase  40.32 
 
 
914 aa  618  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13952e-22 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  42.96 
 
 
888 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3777  pyruvate phosphate dikinase  42.49 
 
 
876 aa  615  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0430097  normal  0.108165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  40.68 
 
 
886 aa  615  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  42.46 
 
 
888 aa  611  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  38.04 
 
 
881 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  42.91 
 
 
894 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  40.32 
 
 
914 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  40.61 
 
 
888 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3044  pyruvate phosphate dikinase  40.14 
 
 
887 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.220677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  41.3 
 
 
881 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  40.05 
 
 
884 aa  605  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1243  pyruvate phosphate dikinase  43.67 
 
 
876 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  39.68 
 
 
912 aa  600  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  38.8 
 
 
882 aa  599  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0856  pyruvate, phosphate dikinase  40.47 
 
 
991 aa  600  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  40.95 
 
 
881 aa  598  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  39.48 
 
 
885 aa  595  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  39.98 
 
 
916 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2386  pyruvate, phosphate dikinase  40.38 
 
 
880 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.728002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  40.52 
 
 
880 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  39.46 
 
 
886 aa  583  1.0000000000000001e-165  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  40.32 
 
 
890 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  39.63 
 
 
912 aa  581  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4251  pyruvate phosphate dikinase  42 
 
 
882 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  39.27 
 
 
940 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  39.48 
 
 
915 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  38.8 
 
 
881 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1501  pyruvate phosphate dikinase  41.47 
 
 
933 aa  573  1.0000000000000001e-162  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000334669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  41.37 
 
 
889 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  42.11 
 
 
847 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  38.72 
 
 
881 aa  572  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  38.58 
 
 
916 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  39.36 
 
 
916 aa  569  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  39.13 
 
 
916 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  38.51 
 
 
873 aa  572  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  40.33 
 
 
882 aa  572  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  39.72 
 
 
874 aa  568  1e-160  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2170  pyruvate phosphate dikinase  38.3 
 
 
875 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1059  pyruvate, phosphate dikinase  40.09 
 
 
882 aa  561  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7028  pyruvate phosphate dikinase  39.8 
 
 
905 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224146 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  38.17 
 
 
916 aa  561  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0369  pyruvate phosphate dikinase  38.69 
 
 
867 aa  561  1e-158  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  39.37 
 
 
984 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  40.32 
 
 
908 aa  557  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>