More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0600 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  59.22 
 
 		 888 aa  1049    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0499  pyruvate phosphate dikinase  46.99 
 
 		 891 aa  775    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.205716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  75.74 
 
 		 888 aa  1406    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0951  pyruvate phosphate dikinase  48.75 
 
 		 887 aa  845    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0613024 
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  58.48 
 
 		 908 aa  1060    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  58.11 
 
 		 916 aa  1040    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1501  pyruvate phosphate dikinase  53.34 
 
 		 933 aa  947    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000334669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  62.81 
 
 		 888 aa  1129    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2170  pyruvate phosphate dikinase  50.06 
 
 		 875 aa  894    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3020  pyruvate phosphate dikinase  52.21 
 
 		 906 aa  885    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  51.81 
 
 		 912 aa  959    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  59.76 
 
 		 890 aa  1075    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  55.57 
 
 		 881 aa  993    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  65.06 
 
 		 887 aa  1185    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  57.94 
 
 		 890 aa  1025    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3429  pyruvate phosphate dikinase  52.24 
 
 		 911 aa  839    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300795  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  64.78 
 
 		 887 aa  1198    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  56.08 
 
 		 984 aa  1002    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  63.43 
 
 		 896 aa  1151    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3806  pyruvate phosphate dikinase  51.69 
 
 		 911 aa  835    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1974  pyruvate phosphate dikinase  55.27 
 
 		 914 aa  998    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.188797  hitchhiker  0.000108707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  59.27 
 
 		 885 aa  1047    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  62.24 
 
 		 888 aa  1117    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0863  pyruvate phosphate dikinase  53.15 
 
 		 891 aa  883    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  52.36 
 
 		 874 aa  912    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  59.91 
 
 		 882 aa  1071    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  61.67 
 
 		 895 aa  1112    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  61.44 
 
 		 1028 aa  1113    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  61.43 
 
 		 881 aa  1084    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  59.38 
 
 		 889 aa  1064    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  75.23 
 
 		 914 aa  1391    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 		 888 aa  1833    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  56.46 
 
 		 961 aa  1004    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  77.66 
 
 		 886 aa  1442    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  57.89 
 
 		 916 aa  1050    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  57.11 
 
 		 916 aa  1037    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  75.97 
 
 		 888 aa  1401    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  64.72 
 
 		 887 aa  1177    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0745  pyruvate, phosphate dikinase  52.47 
 
 		 898 aa  882    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1008  pyruvate phosphate dikinase  47.33 
 
 		 916 aa  798    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  64.49 
 
 		 894 aa  1142    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2401  pyruvate phosphate dikinase  44.75 
 
 		 862 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322611  normal  0.628675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  62.89 
 
 		 886 aa  1105    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  60.8 
 
 		 884 aa  1065    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  59.23 
 
 		 881 aa  1077    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  56.53 
 
 		 962 aa  999    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1276  pyruvate phosphate dikinase  50 
 
 		 897 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.214047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  61.97 
 
 		 1004 aa  1102    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  61.99 
 
 		 887 aa  1115    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1141  pyruvate phosphate dikinase  49.62 
 
 		 916 aa  846    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  59.75 
 
 		 873 aa  1091    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0369  pyruvate phosphate dikinase  49.26 
 
 		 867 aa  867    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  52.76 
 
 		 873 aa  918    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  42.94 
 
 		 845 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0088  pyruvate phosphate dikinase  50.32 
 
 		 931 aa  874    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  62.21 
 
 		 991 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  75.4 
 
 		 892 aa  1400    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  63.29 
 
 		 884 aa  1141    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  62.4 
 
 		 1027 aa  1130    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0344  pyruvate phosphate dikinase  52.51 
 
 		 929 aa  942    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00706754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  61.67 
 
 		 937 aa  1110    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  56.65 
 
 		 912 aa  1003    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16882  predicted protein  46.93 
 
 		 895 aa  723    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.600766  normal  0.576039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2309  pyruvate phosphate dikinase  42.63 
 
 		 854 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0606667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  62.43 
 
 		 885 aa  1105    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  56.95 
 
 		 916 aa  1022    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  63.84 
 
 		 887 aa  1147    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  59.36 
 
 		 876 aa  1088    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  59.47 
 
 		 876 aa  1090    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  57.22 
 
 		 880 aa  1016    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  63.5 
 
 		 890 aa  1144    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  64.83 
 
 		 888 aa  1158    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  57.21 
 
 		 916 aa  1045    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  60.7 
 
 		 883 aa  1118    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2657  pyruvate phosphate dikinase  52.1 
 
 		 916 aa  885    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  61.43 
 
 		 881 aa  1084    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  62.51 
 
 		 898 aa  1138    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  62.77 
 
 		 922 aa  1140    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  56.55 
 
 		 886 aa  1016    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  63.24 
 
 		 877 aa  1145    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  62.43 
 
 		 891 aa  1105    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  63.8 
 
 		 892 aa  1156    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  59.76 
 
 		 939 aa  1077    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  62.63 
 
 		 886 aa  1152    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4089  pyruvate phosphate dikinase  55.17 
 
 		 932 aa  997    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  52.22 
 
 		 896 aa  873    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0642  pyruvate phosphate dikinase  51.99 
 
 		 912 aa  908    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0698603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  75.29 
 
 		 885 aa  1380    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  57.56 
 
 		 940 aa  1040    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2026  pyruvate phosphate dikinase  62.96 
 
 		 896 aa  1057    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  58.61 
 
 		 881 aa  1062    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0987  pyruvate phosphate dikinase  52.03 
 
 		 897 aa  860    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  63.01 
 
 		 889 aa  1128    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  69.46 
 
 		 886 aa  1281    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  56.38 
 
 		 847 aa  919    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0162  pyruvate phosphate dikinase  47.21 
 
 		 912 aa  772    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  59.84 
 
 		 895 aa  1120    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  55.27 
 
 		 882 aa  991    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  62.53 
 
 		 987 aa  1137    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  56.11 
 
 		 915 aa  1017    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>