More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2710 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  55.54 
 
 
889 aa  975    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  63.57 
 
 
888 aa  1165    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  57.35 
 
 
908 aa  1009    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  53.93 
 
 
916 aa  959    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1501  pyruvate phosphate dikinase  51.28 
 
 
933 aa  915    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000334669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2170  pyruvate phosphate dikinase  49.94 
 
 
875 aa  887    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3020  pyruvate phosphate dikinase  51.26 
 
 
906 aa  860    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  51.69 
 
 
912 aa  976    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  55.64 
 
 
886 aa  997    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  67.05 
 
 
888 aa  1207    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  53.79 
 
 
881 aa  975    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  73.57 
 
 
887 aa  1330    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  63.96 
 
 
886 aa  1165    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0745  pyruvate, phosphate dikinase  50.66 
 
 
898 aa  857    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  56.18 
 
 
881 aa  1005    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  69.9 
 
 
898 aa  1276    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  73.46 
 
 
887 aa  1328    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  58.83 
 
 
883 aa  1069    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3806  pyruvate phosphate dikinase  51.97 
 
 
911 aa  824    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  58.84 
 
 
881 aa  1046    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  59.06 
 
 
881 aa  1049    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16882  predicted protein  48.24 
 
 
895 aa  750    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.600766  normal  0.576039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  57.96 
 
 
890 aa  1028    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0863  pyruvate phosphate dikinase  52.37 
 
 
891 aa  865    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  50.85 
 
 
874 aa  907    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  56.54 
 
 
882 aa  1028    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  57.76 
 
 
873 aa  1058    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  71.94 
 
 
1028 aa  1308    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  74.43 
 
 
887 aa  1362    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  56.85 
 
 
881 aa  1023    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  55.46 
 
 
984 aa  961    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  56.46 
 
 
961 aa  973    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  62.54 
 
 
888 aa  1126    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  66.51 
 
 
889 aa  1190    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  54.49 
 
 
916 aa  965    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  54.93 
 
 
915 aa  982    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  54.37 
 
 
916 aa  969    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  62.77 
 
 
888 aa  1149    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1974  pyruvate phosphate dikinase  56.7 
 
 
914 aa  1006    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.188797  hitchhiker  0.000108707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3429  pyruvate phosphate dikinase  52.4 
 
 
911 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300795  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0344  pyruvate phosphate dikinase  51.07 
 
 
929 aa  912    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00706754  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  67.62 
 
 
894 aa  1191    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  76.77 
 
 
886 aa  1348    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  58.97 
 
 
877 aa  1062    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  55.96 
 
 
884 aa  1006    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 
891 aa  1814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  56.35 
 
 
962 aa  967    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1276  pyruvate phosphate dikinase  51.76 
 
 
897 aa  818    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.214047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  76.72 
 
 
1004 aa  1362    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  66.82 
 
 
887 aa  1204    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1141  pyruvate phosphate dikinase  49.51 
 
 
916 aa  854    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  83.41 
 
 
888 aa  1501    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0369  pyruvate phosphate dikinase  50.45 
 
 
867 aa  897    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  50.9 
 
 
873 aa  915    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  44.04 
 
 
845 aa  664    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0088  pyruvate phosphate dikinase  48.77 
 
 
931 aa  866    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  75 
 
 
991 aa  1334    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2401  pyruvate phosphate dikinase  45.86 
 
 
862 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322611  normal  0.628675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  63.23 
 
 
892 aa  1167    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  59.44 
 
 
884 aa  1075    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  76.15 
 
 
1027 aa  1372    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2657  pyruvate phosphate dikinase  50.72 
 
 
916 aa  889    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  73.39 
 
 
937 aa  1329    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  72.13 
 
 
922 aa  1298    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  55.58 
 
 
912 aa  982    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  57.68 
 
 
847 aa  931    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2309  pyruvate phosphate dikinase  45.42 
 
 
854 aa  687    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0606667  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  68.08 
 
 
885 aa  1210    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  58.12 
 
 
885 aa  1042    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  76.08 
 
 
987 aa  1374    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  72.77 
 
 
887 aa  1298    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  57.73 
 
 
876 aa  1059    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  57.85 
 
 
876 aa  1062    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0162  pyruvate phosphate dikinase  47.71 
 
 
912 aa  769    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  55.33 
 
 
880 aa  972    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  67.66 
 
 
890 aa  1226    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  55.48 
 
 
916 aa  983    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  52.35 
 
 
882 aa  949    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0499  pyruvate phosphate dikinase  47.05 
 
 
891 aa  774    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.205716  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  54.15 
 
 
916 aa  967    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  76.15 
 
 
1008 aa  1360    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1008  pyruvate phosphate dikinase  46.89 
 
 
916 aa  766    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  83.07 
 
 
888 aa  1488    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  60.98 
 
 
888 aa  1068    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  76.54 
 
 
892 aa  1380    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  55.17 
 
 
939 aa  980    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  61.27 
 
 
886 aa  1097    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4089  pyruvate phosphate dikinase  54.39 
 
 
932 aa  977    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  53.14 
 
 
896 aa  876    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0642  pyruvate phosphate dikinase  50.71 
 
 
912 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0698603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  64.72 
 
 
885 aa  1167    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  54.6 
 
 
940 aa  972    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0541  pyruvate phosphate dikinase  43.73 
 
 
853 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520973  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0987  pyruvate phosphate dikinase  52.73 
 
 
897 aa  849    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  55.76 
 
 
890 aa  979    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  60.34 
 
 
886 aa  1100    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0951  pyruvate phosphate dikinase  46.31 
 
 
887 aa  794    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0613024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  82.82 
 
 
896 aa  1496    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  67.46 
 
 
895 aa  1256    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  62.78 
 
 
914 aa  1141    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>