More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1351 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  59.86 
 
 
896 aa  1079    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1974  pyruvate phosphate dikinase  56.33 
 
 
914 aa  1026    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.188797  hitchhiker  0.000108707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  62.29 
 
 
890 aa  1132    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  60.16 
 
 
898 aa  1104    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  63.85 
 
 
888 aa  1167    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  60.8 
 
 
886 aa  1062    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  56.67 
 
 
908 aa  1039    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  58.84 
 
 
916 aa  1052    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1501  pyruvate phosphate dikinase  54.48 
 
 
933 aa  956    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000334669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3806  pyruvate phosphate dikinase  51.54 
 
 
911 aa  885    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2170  pyruvate phosphate dikinase  54.84 
 
 
875 aa  998    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3020  pyruvate phosphate dikinase  52.01 
 
 
906 aa  921    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  52.31 
 
 
912 aa  967    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  59.95 
 
 
890 aa  1069    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16882  predicted protein  47.87 
 
 
895 aa  776    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.600766  normal  0.576039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  60.37 
 
 
881 aa  1107    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  61.26 
 
 
887 aa  1116    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  61.89 
 
 
888 aa  1105    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  65 
 
 
881 aa  1166    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  60.23 
 
 
1008 aa  1078    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  62.19 
 
 
887 aa  1142    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  57.48 
 
 
984 aa  1048    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  61.03 
 
 
887 aa  1109    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  59.91 
 
 
889 aa  1074    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  58.86 
 
 
891 aa  1039    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  62.66 
 
 
881 aa  1141    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0863  pyruvate phosphate dikinase  53.91 
 
 
891 aa  909    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  51.08 
 
 
874 aa  897    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  60.93 
 
 
882 aa  1090    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  68.92 
 
 
873 aa  1264    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  58.86 
 
 
1028 aa  1072    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1008  pyruvate phosphate dikinase  50.56 
 
 
916 aa  873    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  57.59 
 
 
961 aa  1050    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  63.24 
 
 
888 aa  1146    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  57.89 
 
 
916 aa  1042    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  59.46 
 
 
916 aa  1068    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  64.24 
 
 
888 aa  1157    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  65.94 
 
 
881 aa  1177    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0344  pyruvate phosphate dikinase  52.24 
 
 
929 aa  919    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00706754  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  59.59 
 
 
894 aa  1052    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  60.11 
 
 
895 aa  1078    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  65.94 
 
 
881 aa  1178    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  62.3 
 
 
884 aa  1100    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  57.81 
 
 
962 aa  1043    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1276  pyruvate phosphate dikinase  49.72 
 
 
897 aa  828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.214047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  59.77 
 
 
1004 aa  1076    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  61.22 
 
 
887 aa  1110    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1141  pyruvate phosphate dikinase  50.98 
 
 
916 aa  904    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  60.34 
 
 
987 aa  1107    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0369  pyruvate phosphate dikinase  50.46 
 
 
867 aa  901    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  52.45 
 
 
873 aa  919    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  42.14 
 
 
845 aa  638    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0088  pyruvate phosphate dikinase  51.19 
 
 
931 aa  917    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  65.15 
 
 
886 aa  1150    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  59.23 
 
 
991 aa  1068    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  57.11 
 
 
916 aa  1037    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  63.04 
 
 
884 aa  1114    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  59.91 
 
 
1027 aa  1085    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  56.29 
 
 
847 aa  936    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  59.2 
 
 
937 aa  1068    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3429  pyruvate phosphate dikinase  50.55 
 
 
911 aa  866    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300795  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  59.98 
 
 
912 aa  1071    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  61.08 
 
 
885 aa  1073    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0662  pyruvate phosphate dikinase  59.53 
 
 
894 aa  1068    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  61.1 
 
 
885 aa  1092    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  60.39 
 
 
922 aa  1075    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  62.97 
 
 
887 aa  1129    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  70.31 
 
 
876 aa  1282    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  70.31 
 
 
876 aa  1285    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  59.02 
 
 
888 aa  1061    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  58.26 
 
 
880 aa  1060    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  61.26 
 
 
890 aa  1103    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  59.17 
 
 
916 aa  1050    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  62.07 
 
 
889 aa  1125    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  59.66 
 
 
888 aa  1066    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  59.89 
 
 
888 aa  1066    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  65.3 
 
 
886 aa  1181    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 
877 aa  1801    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2657  pyruvate phosphate dikinase  53.08 
 
 
916 aa  931    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  60.11 
 
 
892 aa  1079    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  57.67 
 
 
939 aa  1067    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  57.77 
 
 
886 aa  1067    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4089  pyruvate phosphate dikinase  57.14 
 
 
932 aa  1022    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  54.31 
 
 
896 aa  925    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0642  pyruvate phosphate dikinase  53.01 
 
 
912 aa  947    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0698603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  62.6 
 
 
885 aa  1142    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  58.84 
 
 
940 aa  1050    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0541  pyruvate phosphate dikinase  41.84 
 
 
853 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520973  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0499  pyruvate phosphate dikinase  50.17 
 
 
891 aa  859    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.205716  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0987  pyruvate phosphate dikinase  51.19 
 
 
897 aa  874    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  56.2 
 
 
882 aa  1013    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  60.57 
 
 
886 aa  1103    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2026  pyruvate phosphate dikinase  57.11 
 
 
896 aa  982    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  59.21 
 
 
895 aa  1074    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0162  pyruvate phosphate dikinase  50.67 
 
 
912 aa  865    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  64.35 
 
 
892 aa  1158    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  58.12 
 
 
915 aa  1035    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0951  pyruvate phosphate dikinase  51.44 
 
 
887 aa  877    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0613024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  77.61 
 
 
883 aa  1418    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  63.13 
 
 
914 aa  1131    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>