More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2401 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  46.81 
 
 		 898 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0716  pyruvate phosphate dikinase  48.24 
 
 		 899 aa  680    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  46.68 
 
 		 887 aa  673    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1409  pyruvate phosphate dikinase  45.74 
 
 		 883 aa  677    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000166258  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2401  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 		 862 aa  1735    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322611  normal  0.628675 
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  46.68 
 
 		 887 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0645  pyruvate phosphate dikinase  65.22 
 
 		 852 aa  1051    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.211881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0662  pyruvate phosphate dikinase  46.08 
 
 		 894 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3117  pyruvate phosphate dikinase  46.68 
 
 		 888 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38254  normal  0.157801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  47.19 
 
 		 888 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  46.27 
 
 		 1028 aa  653    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1859  pyruvate phosphate dikinase  66.06 
 
 		 848 aa  1063    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  44.3 
 
 		 888 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  46.99 
 
 		 889 aa  680    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  47.19 
 
 		 1004 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  46.47 
 
 		 887 aa  659    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  65.75 
 
 		 845 aa  1062    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2849  pyruvate phosphate dikinase  46.68 
 
 		 891 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.543081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  45.79 
 
 		 991 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  45.92 
 
 		 1008 aa  661    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  46.94 
 
 		 1027 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  46.3 
 
 		 937 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2309  pyruvate phosphate dikinase  66.63 
 
 		 854 aa  1129    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0606667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  44.35 
 
 		 885 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0508  pyruvate phosphate dikinase  66.06 
 
 		 848 aa  1063    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.83558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  43.66 
 
 		 895 aa  666    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  47.03 
 
 		 887 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  45.66 
 
 		 891 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  46.56 
 
 		 888 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  43.16 
 
 		 890 aa  643    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  46.68 
 
 		 888 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  45.15 
 
 		 922 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  42.97 
 
 		 883 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  44.7 
 
 		 892 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0942  pyruvate, phosphate dikinase  44.43 
 
 		 893 aa  638    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214985  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1102  pyruvate phosphate dikinase  46.35 
 
 		 894 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0541  pyruvate phosphate dikinase  63.9 
 
 		 853 aa  1019    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  46.43 
 
 		 896 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  46.47 
 
 		 887 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  46.73 
 
 		 987 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  43.89 
 
 		 895 aa  661    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0717  pyruvate phosphate dikinase  46.22 
 
 		 901 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1318  pyruvate phosphate dikinase  43.75 
 
 		 889 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  43.09 
 
 		 892 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  42.73 
 
 		 884 aa  634  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0356  pyruvate, phosphate dikinase  39.47 
 
 		 912 aa  634  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  46.17 
 
 		 886 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  43.54 
 
 		 885 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0657  pyruvate phosphate dikinase  43.25 
 
 		 914 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13952e-22 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  44.39 
 
 		 888 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  43.15 
 
 		 877 aa  628  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  43.62 
 
 		 886 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  41.19 
 
 		 876 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  41.32 
 
 		 876 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  42.33 
 
 		 886 aa  624  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  43.26 
 
 		 888 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  42.88 
 
 		 888 aa  618  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  45.41 
 
 		 894 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  43.13 
 
 		 914 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  42.82 
 
 		 886 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  42.42 
 
 		 890 aa  616  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1243  pyruvate phosphate dikinase  42.64 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  43.57 
 
 		 881 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  39.88 
 
 		 881 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  40.9 
 
 		 873 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  43.18 
 
 		 881 aa  601  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  42.37 
 
 		 884 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  41.32 
 
 		 882 aa  596  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  41.16 
 
 		 882 aa  594  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3044  pyruvate phosphate dikinase  41.54 
 
 		 887 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.220677 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  41.86 
 
 		 886 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3777  pyruvate phosphate dikinase  43.44 
 
 		 876 aa  592  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0430097  normal  0.108165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4251  pyruvate phosphate dikinase  41.7 
 
 		 882 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  38.75 
 
 		 912 aa  585  1e-166  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  40.84 
 
 		 885 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  41.09 
 
 		 880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  42.17 
 
 		 881 aa  583  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0856  pyruvate, phosphate dikinase  39.76 
 
 		 991 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2386  pyruvate, phosphate dikinase  39.37 
 
 		 880 aa  582  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.728002  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  38.31 
 
 		 873 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  41.76 
 
 		 889 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  41.11 
 
 		 912 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  41.18 
 
 		 881 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  41.64 
 
 		 890 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  41.07 
 
 		 916 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  40.15 
 
 		 908 aa  574  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  41.67 
 
 		 916 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  41.16 
 
 		 939 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  40.47 
 
 		 940 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  38.56 
 
 		 874 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1059  pyruvate, phosphate dikinase  41.68 
 
 		 882 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1501  pyruvate phosphate dikinase  40.17 
 
 		 933 aa  561  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000334669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  40.1 
 
 		 916 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3217  pyruvate, phosphate dikinase  41.92 
 
 		 898 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211138  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  40.84 
 
 		 916 aa  559  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1608  pyruvate phosphate dikinase  40.56 
 
 		 892 aa  558  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.470093  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  41.85 
 
 		 847 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  40.02 
 
 		 916 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7028  pyruvate phosphate dikinase  40.62 
 
 		 905 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224146 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  40.52 
 
 		 915 aa  551  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>