More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1243 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3429  pyruvate phosphate dikinase  51.2 
 
 		 911 aa  829    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300795  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  69.84 
 
 		 898 aa  1284    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  62.17 
 
 		 888 aa  1158    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  58.12 
 
 		 908 aa  1037    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  55.74 
 
 		 961 aa  986    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1501  pyruvate phosphate dikinase  51.55 
 
 		 933 aa  931    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000334669  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0162  pyruvate phosphate dikinase  45.73 
 
 		 912 aa  754    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2170  pyruvate phosphate dikinase  49.72 
 
 		 875 aa  895    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3020  pyruvate phosphate dikinase  50.11 
 
 		 906 aa  842    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  52.42 
 
 		 912 aa  1005    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  68 
 
 		 895 aa  1231    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  75.25 
 
 		 896 aa  1373    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  57.78 
 
 		 885 aa  1053    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  55.09 
 
 		 881 aa  1007    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  73.28 
 
 		 887 aa  1355    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  76.58 
 
 		 888 aa  1386    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  55.65 
 
 		 916 aa  1000    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  62.4 
 
 		 886 aa  1163    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16882  predicted protein  46.24 
 
 		 895 aa  737    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.600766  normal  0.576039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  68.25 
 
 		 922 aa  1258    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  54.71 
 
 		 916 aa  979    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  56.37 
 
 		 881 aa  1030    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1008  pyruvate phosphate dikinase  45.24 
 
 		 916 aa  756    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  55.69 
 
 		 881 aa  1006    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  58 
 
 		 883 aa  1067    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  72.96 
 
 		 887 aa  1372    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0863  pyruvate phosphate dikinase  52.59 
 
 		 891 aa  863    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  50 
 
 		 874 aa  908    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  56.34 
 
 		 882 aa  1033    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  76.17 
 
 		 891 aa  1368    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  78.88 
 
 		 1028 aa  1570    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  59.75 
 
 		 888 aa  1067    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  68.33 
 
 		 895 aa  1286    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  57.46 
 
 		 890 aa  1032    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  62.4 
 
 		 914 aa  1144    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  62.17 
 
 		 888 aa  1131    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0645  pyruvate phosphate dikinase  44.9 
 
 		 852 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.211881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  54.8 
 
 		 916 aa  994    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  55.48 
 
 		 916 aa  990    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  62.16 
 
 		 888 aa  1152    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  76.26 
 
 		 886 aa  1372    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  58.93 
 
 		 881 aa  1058    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1974  pyruvate phosphate dikinase  54 
 
 		 914 aa  971    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.188797  hitchhiker  0.000108707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  66.17 
 
 		 894 aa  1183    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3806  pyruvate phosphate dikinase  51.2 
 
 		 911 aa  835    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2657  pyruvate phosphate dikinase  51.05 
 
 		 916 aa  877    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  56.19 
 
 		 884 aa  1032    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  57.78 
 
 		 873 aa  1061    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  55.96 
 
 		 962 aa  981    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1276  pyruvate phosphate dikinase  51.31 
 
 		 897 aa  810    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.214047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  92.26 
 
 		 1004 aa  1687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  65.23 
 
 		 887 aa  1196    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1141  pyruvate phosphate dikinase  49.84 
 
 		 916 aa  857    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  60.23 
 
 		 877 aa  1094    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0369  pyruvate phosphate dikinase  51.53 
 
 		 867 aa  922    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  50.62 
 
 		 873 aa  926    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  46.01 
 
 		 845 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0088  pyruvate phosphate dikinase  49.95 
 
 		 931 aa  886    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  63.66 
 
 		 892 aa  1181    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  56.01 
 
 		 847 aa  910    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  59.21 
 
 		 884 aa  1078    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  87.16 
 
 		 1027 aa  1702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  55.76 
 
 		 889 aa  991    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  86.02 
 
 		 937 aa  1606    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  54.37 
 
 		 915 aa  973    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  54.86 
 
 		 912 aa  984    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  66.51 
 
 		 889 aa  1199    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2309  pyruvate phosphate dikinase  43.97 
 
 		 854 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0606667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  65.48 
 
 		 885 aa  1181    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0499  pyruvate phosphate dikinase  45.54 
 
 		 891 aa  763    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.205716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0951  pyruvate phosphate dikinase  46.88 
 
 		 887 aa  817    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0613024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  72.09 
 
 		 887 aa  1313    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  57.85 
 
 		 876 aa  1075    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2401  pyruvate phosphate dikinase  46.35 
 
 		 862 aa  669    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322611  normal  0.628675 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  57.96 
 
 		 876 aa  1077    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  73.17 
 
 		 887 aa  1352    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  56.54 
 
 		 890 aa  1009    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  54.64 
 
 		 984 aa  972    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  55.11 
 
 		 880 aa  997    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  68.46 
 
 		 890 aa  1266    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  55.53 
 
 		 886 aa  1010    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  76.13 
 
 		 888 aa  1377    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0344  pyruvate phosphate dikinase  52.53 
 
 		 929 aa  932    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00706754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4089  pyruvate phosphate dikinase  53.87 
 
 		 932 aa  982    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  65.14 
 
 		 888 aa  1172    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  58.93 
 
 		 881 aa  1059    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 		 1008 aa  2067    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  56.22 
 
 		 939 aa  1004    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  59.75 
 
 		 886 aa  1108    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  74.68 
 
 		 892 aa  1377    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  52.63 
 
 		 896 aa  882    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0642  pyruvate phosphate dikinase  50.17 
 
 		 912 aa  885    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0698603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  64.23 
 
 		 885 aa  1171    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  55.92 
 
 		 940 aa  998    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0541  pyruvate phosphate dikinase  43.82 
 
 		 853 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  55.04 
 
 		 916 aa  980    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0987  pyruvate phosphate dikinase  50.62 
 
 		 897 aa  845    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  52.56 
 
 		 882 aa  958    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  85.22 
 
 		 987 aa  1649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  59.45 
 
 		 886 aa  1084    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>