More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0716 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  53.93 
 
 		 916 aa  954    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  61.67 
 
 		 888 aa  1124    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  56.23 
 
 		 881 aa  1011    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  53.42 
 
 		 908 aa  960    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  52.93 
 
 		 916 aa  942    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1501  pyruvate phosphate dikinase  50.22 
 
 		 933 aa  885    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000334669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  56.7 
 
 		 883 aa  1012    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2170  pyruvate phosphate dikinase  49.49 
 
 		 875 aa  875    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3020  pyruvate phosphate dikinase  50.77 
 
 		 906 aa  839    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  51.21 
 
 		 912 aa  964    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  72.08 
 
 		 891 aa  1291    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  72.77 
 
 		 886 aa  1280    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  52.53 
 
 		 881 aa  949    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  72.31 
 
 		 887 aa  1310    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  54.48 
 
 		 984 aa  936    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  57.82 
 
 		 890 aa  1005    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3806  pyruvate phosphate dikinase  50.6 
 
 		 911 aa  809    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2401  pyruvate phosphate dikinase  48.24 
 
 		 862 aa  674    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322611  normal  0.628675 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  54.73 
 
 		 847 aa  880    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  54.64 
 
 		 889 aa  949    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2657  pyruvate phosphate dikinase  50.88 
 
 		 916 aa  850    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  69.18 
 
 		 898 aa  1250    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  72.2 
 
 		 887 aa  1306    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  52.82 
 
 		 915 aa  949    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0863  pyruvate phosphate dikinase  51.49 
 
 		 891 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  49.94 
 
 		 874 aa  905    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  54.13 
 
 		 882 aa  964    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0951  pyruvate phosphate dikinase  45.98 
 
 		 887 aa  776    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0613024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  68.81 
 
 		 1028 aa  1252    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  52.68 
 
 		 882 aa  944    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  66.59 
 
 		 895 aa  1234    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  54.9 
 
 		 881 aa  986    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  63.42 
 
 		 889 aa  1142    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0645  pyruvate phosphate dikinase  47.39 
 
 		 852 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.211881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  54.87 
 
 		 961 aa  931    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  61.44 
 
 		 888 aa  1107    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  52.93 
 
 		 916 aa  934    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  53.71 
 
 		 916 aa  961    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  60.82 
 
 		 888 aa  1117    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  54.42 
 
 		 890 aa  949    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  72.57 
 
 		 887 aa  1340    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  70.02 
 
 		 987 aa  1297    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  65.1 
 
 		 894 aa  1152    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  64.38 
 
 		 895 aa  1158    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  52.49 
 
 		 916 aa  931    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  56.12 
 
 		 884 aa  977    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16882  predicted protein  46.47 
 
 		 895 aa  721    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.600766  normal  0.576039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  54.7 
 
 		 962 aa  922    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1276  pyruvate phosphate dikinase  51.54 
 
 		 897 aa  813    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.214047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  70.64 
 
 		 1004 aa  1280    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  63.47 
 
 		 887 aa  1139    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1141  pyruvate phosphate dikinase  48.31 
 
 		 916 aa  815    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0499  pyruvate phosphate dikinase  46.64 
 
 		 891 aa  764    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.205716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0369  pyruvate phosphate dikinase  50.34 
 
 		 867 aa  885    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  49.94 
 
 		 873 aa  899    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  44.6 
 
 		 845 aa  669    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0088  pyruvate phosphate dikinase  47.22 
 
 		 931 aa  818    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0162  pyruvate phosphate dikinase  46.07 
 
 		 912 aa  730    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  70.07 
 
 		 991 aa  1277    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  58.29 
 
 		 877 aa  1050    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  57.35 
 
 		 881 aa  1026    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  61.4 
 
 		 892 aa  1131    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  56.74 
 
 		 884 aa  1020    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  69.5 
 
 		 1027 aa  1281    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  71.56 
 
 		 896 aa  1290    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  69.72 
 
 		 937 aa  1270    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  57.58 
 
 		 881 aa  1028    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  53.84 
 
 		 912 aa  932    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  69.84 
 
 		 1008 aa  1274    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2309  pyruvate phosphate dikinase  46.06 
 
 		 854 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0606667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  65.1 
 
 		 885 aa  1152    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  55.25 
 
 		 873 aa  1001    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  69.79 
 
 		 887 aa  1247    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  56.13 
 
 		 876 aa  1009    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1008  pyruvate phosphate dikinase  46.07 
 
 		 916 aa  743    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  56.13 
 
 		 876 aa  1010    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1974  pyruvate phosphate dikinase  54.99 
 
 		 914 aa  978    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.188797  hitchhiker  0.000108707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  64.08 
 
 		 888 aa  1150    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  53.54 
 
 		 880 aa  942    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  64.38 
 
 		 890 aa  1166    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  71.85 
 
 		 888 aa  1292    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3429  pyruvate phosphate dikinase  50.49 
 
 		 911 aa  808    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300795  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0344  pyruvate phosphate dikinase  50.22 
 
 		 929 aa  885    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00706754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  68 
 
 		 922 aa  1227    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  57.26 
 
 		 885 aa  999    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  60.71 
 
 		 886 aa  1119    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  54.39 
 
 		 886 aa  979    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  71.28 
 
 		 888 aa  1286    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  75.29 
 
 		 892 aa  1385    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  53.99 
 
 		 939 aa  953    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  59.34 
 
 		 886 aa  1086    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4089  pyruvate phosphate dikinase  53.11 
 
 		 932 aa  955    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  51.54 
 
 		 896 aa  846    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0642  pyruvate phosphate dikinase  50.66 
 
 		 912 aa  852    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0698603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  61.17 
 
 		 885 aa  1112    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  53.05 
 
 		 940 aa  951    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0541  pyruvate phosphate dikinase  44.98 
 
 		 853 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0987  pyruvate phosphate dikinase  50 
 
 		 897 aa  822    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  58.29 
 
 		 886 aa  1050    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  59.98 
 
 		 888 aa  1054    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>