More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0645 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  47.8 
 
 		 887 aa  695    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  48.81 
 
 		 887 aa  690    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2401  pyruvate phosphate dikinase  65.32 
 
 		 862 aa  1080    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322611  normal  0.628675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  48.56 
 
 		 887 aa  686    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0356  pyruvate, phosphate dikinase  40.97 
 
 		 912 aa  639    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  45.41 
 
 		 987 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1859  pyruvate phosphate dikinase  96.34 
 
 		 848 aa  1580    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  44.66 
 
 		 888 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  44.15 
 
 		 1004 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  46.73 
 
 		 887 aa  664    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0716  pyruvate phosphate dikinase  47.5 
 
 		 899 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  47.2 
 
 		 889 aa  665    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0717  pyruvate phosphate dikinase  47.69 
 
 		 901 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2730  pyruvate phosphate dikinase  63.52 
 
 		 845 aa  1044    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0662  pyruvate phosphate dikinase  46.89 
 
 		 894 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  43.79 
 
 		 991 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  44.61 
 
 		 1008 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  42.03 
 
 		 884 aa  648    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  44.61 
 
 		 1027 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  46.06 
 
 		 888 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  44.26 
 
 		 937 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3117  pyruvate phosphate dikinase  46.06 
 
 		 888 aa  641    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38254  normal  0.157801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2309  pyruvate phosphate dikinase  67.27 
 
 		 854 aa  1115    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0606667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  48.06 
 
 		 885 aa  657    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  43.26 
 
 		 892 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  46.95 
 
 		 891 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  46.89 
 
 		 887 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  47.84 
 
 		 898 aa  683    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0645  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 		 852 aa  1706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.211881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  46.37 
 
 		 888 aa  643    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1409  pyruvate phosphate dikinase  45.1 
 
 		 883 aa  664    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000166258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2849  pyruvate phosphate dikinase  46.51 
 
 		 891 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.543081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1102  pyruvate phosphate dikinase  46.38 
 
 		 894 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0541  pyruvate phosphate dikinase  69.31 
 
 		 853 aa  1114    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  43.71 
 
 		 883 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  45.63 
 
 		 896 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  44.16 
 
 		 895 aa  648    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  43.71 
 
 		 886 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0508  pyruvate phosphate dikinase  96.34 
 
 		 848 aa  1580    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.83558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  45.1 
 
 		 895 aa  663    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  45.73 
 
 		 1028 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  43.07 
 
 		 877 aa  632  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  42.98 
 
 		 892 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  44.68 
 
 		 886 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  44.57 
 
 		 885 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  43.26 
 
 		 922 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  45.17 
 
 		 890 aa  632  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  46.46 
 
 		 888 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  44.58 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1318  pyruvate phosphate dikinase  43.68 
 
 		 889 aa  625  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0942  pyruvate, phosphate dikinase  43.74 
 
 		 893 aa  616  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3777  pyruvate phosphate dikinase  45.17 
 
 		 876 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0430097  normal  0.108165 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  44.35 
 
 		 888 aa  613  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  45.82 
 
 		 894 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  42.42 
 
 		 876 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  42.29 
 
 		 886 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  41.25 
 
 		 888 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  43.04 
 
 		 888 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0657  pyruvate phosphate dikinase  41.81 
 
 		 914 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13952e-22 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  42.3 
 
 		 876 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  43.61 
 
 		 881 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  43.61 
 
 		 881 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  42.18 
 
 		 914 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0856  pyruvate, phosphate dikinase  40.8 
 
 		 991 aa  601  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  39 
 
 		 912 aa  601  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  41.2 
 
 		 885 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  39.67 
 
 		 881 aa  594  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  41 
 
 		 882 aa  593  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  40.49 
 
 		 873 aa  594  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  43.68 
 
 		 890 aa  592  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  41.73 
 
 		 886 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3044  pyruvate phosphate dikinase  41.71 
 
 		 887 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.220677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  42.3 
 
 		 912 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  42.26 
 
 		 881 aa  590  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  43.55 
 
 		 889 aa  591  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  38.99 
 
 		 882 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  41.53 
 
 		 884 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  41.89 
 
 		 881 aa  581  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  41.26 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  41.77 
 
 		 916 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  39.03 
 
 		 886 aa  575  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4251  pyruvate phosphate dikinase  41.07 
 
 		 882 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  43.81 
 
 		 961 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0330  pyruvate phosphate dikinase  38.46 
 
 		 873 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4187  pyruvate phosphate dikinase  43.94 
 
 		 961 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0757879  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1059  pyruvate, phosphate dikinase  41.93 
 
 		 882 aa  568  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  42.87 
 
 		 984 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1243  pyruvate phosphate dikinase  41.02 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  43.25 
 
 		 962 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1017  pyruvate phosphate dikinase  40.29 
 
 		 908 aa  561  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0702546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  39.95 
 
 		 916 aa  562  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  41.78 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1608  pyruvate phosphate dikinase  41.7 
 
 		 892 aa  558  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.470093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3206  pyruvate, phosphate dikinase  41.55 
 
 		 877 aa  558  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0226352  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29856  predicted protein  41.49 
 
 		 847 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0486692  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  39.95 
 
 		 940 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0675  pyruvate phosphate dikinase  38.12 
 
 		 874 aa  552  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  40.07 
 
 		 916 aa  555  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  41.22 
 
 		 896 aa  554  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  39.65 
 
 		 916 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>