33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0163 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0163  cobalamin B12-binding  100 
 
 		 289 aa  580  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3532  regulatory protein PpaA  37.35 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0283  regulatory protein, PpaA  33.33 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1926  regulatory protein, PpaA  33.33 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.120829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1012  hypothetical protein  32.29 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.196358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0678  hypothetical protein  31.91 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  25.53 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  26.7 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  27.03 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0776  cobalamin B12-binding domain protein  25.79 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1311  cobalamin B12-binding  27.07 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2044  cobalamin B12-binding domain protein  29.63 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.10014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  25 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3716  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103124  hitchhiker  0.00389814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  25.35 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5285  cobalamin B12-binding  26.39 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.109441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6022  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0324177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  28.36 
 
 		 714 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  27.61 
 
 		 709 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  27.61 
 
 		 709 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  18.81 
 
 		 212 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  20.51 
 
 		 216 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  27.36 
 
 		 768 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.88 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  26.5 
 
 		 372 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  21.1 
 
 		 780 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  27.45 
 
 		 709 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  23.45 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1850  cobalamin B12-binding  26.22 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  decreased coverage  0.0003313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  23.45 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.52 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  26.12 
 
 		 709 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0261  cobalamin B12-binding  37.21 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>