46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1850 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1850  cobalamin B12-binding  100 
 
 		 296 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  decreased coverage  0.0003313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  51.49 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  52 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5285  cobalamin B12-binding  51.34 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.109441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6022  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.28 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0324177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3716  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.28 
 
 		 288 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103124  hitchhiker  0.00389814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1311  cobalamin B12-binding  37.4 
 
 		 289 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  35.77 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  36.73 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2044  cobalamin B12-binding domain protein  38.4 
 
 		 322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.10014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6420  regulatory protein  37.22 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  37.5 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0262  AppA/PpaA family photosynthesis gene regulator  36.33 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0460  AppA/PpaA family photosynthesis gene regulator  32.93 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.673068  normal  0.054153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0261  cobalamin B12-binding  33.33 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667816  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0298  AppA/PpaA family photosynthesis gene regulator  30.92 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0678  hypothetical protein  33.78 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  31.49 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  26.24 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3532  regulatory protein PpaA  28.31 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0776  cobalamin B12-binding domain protein  31.47 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.11 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1012  hypothetical protein  29.7 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.196358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 356 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  25.97 
 
 		 372 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1926  regulatory protein, PpaA  29.7 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.120829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0283  regulatory protein, PpaA  29.7 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  29.31 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  23.23 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  27.69 
 
 		 232 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  26.73 
 
 		 201 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  25.58 
 
 		 780 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  29.77 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  31.25 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  26.4 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  27.69 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  27.69 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  24.86 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  26.92 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0163  cobalamin B12-binding  23.79 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0625  hypothetical protein  27.66 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  25.14 
 
 		 801 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  26.15 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  32.97 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>