59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6022 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6022  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0324177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  49.8 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  51.23 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5285  cobalamin B12-binding  50.41 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.109441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1850  cobalamin B12-binding  55.6 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  decreased coverage  0.0003313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3716  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.85 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103124  hitchhiker  0.00389814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2044  cobalamin B12-binding domain protein  37.96 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.10014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  34.02 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1311  cobalamin B12-binding  34.76 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  34.44 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6420  regulatory protein  33.05 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  35.64 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0460  AppA/PpaA family photosynthesis gene regulator  35.59 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.673068  normal  0.054153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0262  AppA/PpaA family photosynthesis gene regulator  35.97 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0261  cobalamin B12-binding  41.76 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667816  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0298  AppA/PpaA family photosynthesis gene regulator  35.11 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3532  regulatory protein PpaA  29.27 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  29 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0678  hypothetical protein  27.14 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0163  cobalamin B12-binding  26.02 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1012  hypothetical protein  29.89 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.196358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0283  regulatory protein, PpaA  31.25 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1926  regulatory protein, PpaA  31.25 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.120829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  29.41 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  23.4 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0776  cobalamin B12-binding domain protein  32.11 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  28.33 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.62 
 
 		 370 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  29.68 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  27.18 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  26.07 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  27.04 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  27.1 
 
 		 801 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  26.06 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  26.83 
 
 		 791 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  20.99 
 
 		 372 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 356 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  24.02 
 
 		 807 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  25.47 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  31.36 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  27.74 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  23.61 
 
 		 804 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  29.03 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  33.33 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  29.82 
 
 		 236 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  28.39 
 
 		 804 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  30.51 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  25 
 
 		 218 aa  42.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.62 
 
 		 804 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  23.89 
 
 		 804 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  27.74 
 
 		 210 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  26.19 
 
 		 209 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>