More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3811 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
543 aa  1092    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  64.59 
 
 
550 aa  727    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3827  AMP-dependent synthetase and ligase  51.55 
 
 
547 aa  566  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.246133  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6334  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
533 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 
516 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4009  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
540 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00896755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 
532 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3355  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
537 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
499 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
526 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
518 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
525 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0820  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
538 aa  207  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.83 
 
 
565 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.55 
 
 
529 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 
509 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 
579 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.9 
 
 
556 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 
556 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 
556 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 
536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
501 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.18 
 
 
503 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.3 
 
 
518 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 
517 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
620 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
530 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 
552 aa  193  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
534 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
515 aa  193  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.06 
 
 
570 aa  193  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 
525 aa  193  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
507 aa  193  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2795  acyl-CoA synthetase  30.28 
 
 
548 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
530 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
1043 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
527 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
531 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
528 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  30.49 
 
 
490 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
521 aa  191  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 
513 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 
523 aa  190  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 
554 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35940  acyl-CoA synthetase  30.51 
 
 
548 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629004  hitchhiker  4.55863e-16 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 
518 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
511 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.81 
 
 
525 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
530 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.97 
 
 
492 aa  187  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
508 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 
515 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
523 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.49 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 
508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 
525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 
518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  30.75 
 
 
544 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 
541 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 
534 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
508 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
505 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2016  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 
534 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 
530 aa  183  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 
516 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 
518 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 
512 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 
515 aa  183  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3198  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
509 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.179395  normal  0.194105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.68 
 
 
525 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 
545 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.24 
 
 
482 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.49 
 
 
526 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
520 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  29.49 
 
 
503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5258  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 
505 aa  181  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
520 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.21 
 
 
481 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.4 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.05 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.05 
 
 
482 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 
527 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  28.73 
 
 
596 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.05 
 
 
482 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.38 
 
 
517 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.38 
 
 
517 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.38 
 
 
517 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
517 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
531 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.05 
 
 
482 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 
511 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.36 
 
 
526 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
503 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
534 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.84 
 
 
482 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>