More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1369 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3355  AMP-dependent synthetase and ligase  78.93 
 
 
537 aa  884    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
541 aa  1107    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00896755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  60.15 
 
 
532 aa  642    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0820  AMP-dependent synthetase and ligase  75.28 
 
 
538 aa  848    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4009  AMP-dependent synthetase and ligase  71.22 
 
 
540 aa  793    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 
530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  47.07 
 
 
523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  44.4 
 
 
531 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  43.51 
 
 
560 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0588  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 
515 aa  367  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2093  acyl-CoA synthetase  41.15 
 
 
542 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0900  acyl-CoA synthetase  42.19 
 
 
540 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0183173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8058  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 
514 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09660  acyl-CoA synthetase  42.01 
 
 
540 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00865902  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0030  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 
541 aa  360  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25250  acyl-CoA synthetase  42.14 
 
 
540 aa  360  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  39.74 
 
 
511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2165  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
511 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2052  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 
523 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3817  acyl-CoA synthetase  40.96 
 
 
539 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710335  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0056  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 
517 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2369  acyl-CoA synthetase  40.78 
 
 
540 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2221  acyl-CoA synthetase  40.56 
 
 
540 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 
521 aa  343  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4911  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
550 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2795  acyl-CoA synthetase  39.19 
 
 
548 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1658  acyl-CoA synthetase  41.26 
 
 
542 aa  339  8e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.125326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3553  acyl-CoA synthetase  40.19 
 
 
540 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817597  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6221  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 
550 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1170  acyl-CoA synthetase  38.18 
 
 
543 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0279011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2009  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
652 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.497537  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6109  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 
558 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2536  acyl-CoA synthetase  39.63 
 
 
558 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35940  acyl-CoA synthetase  39.15 
 
 
548 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629004  hitchhiker  4.55863e-16 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6026  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 
550 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2080  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 
543 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 
550 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1565  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 
543 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2005  acyl-CoA synthetase  38.5 
 
 
547 aa  331  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0857661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2139  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 
510 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00340714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2709  acyl-CoA synthetase  38.69 
 
 
549 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0511  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
551 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4259  AMP-binding protein  36.8 
 
 
541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4096  acyl-CoA synthetase  38.32 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0212968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3119  acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 
549 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5768  acyl-CoA synthetase  39.56 
 
 
544 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915964  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2076  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 
556 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0086171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0063  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 
550 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488746  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2483  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
548 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2684  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 
549 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
545 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
559 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0833  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 
541 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0919846  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 
543 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.586965  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0683  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
550 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000214245  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 
550 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0896483  normal  0.0414381 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6506  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
545 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00389964  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2720  acyl-CoA synthetase  37.94 
 
 
549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120351  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 
542 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.656252  hitchhiker  0.0000000000010579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1502  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 
545 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 
544 aa  319  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 
545 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0550813  normal  0.598947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4913  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 
545 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7038  hypothetical protein  39 
 
 
544 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4590  acyl-CoA synthetase  38.15 
 
 
551 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.907923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1108  acyl-CoA synthetase  38.15 
 
 
551 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4308  acyl-CoA synthetase  39.3 
 
 
544 aa  317  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458975  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0019  acyl-CoA synthetase  38.29 
 
 
544 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
542 aa  316  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591871  normal  0.469505 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 
549 aa  315  9e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3590  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 
547 aa  313  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3222  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 
550 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831142  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4295  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 
550 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4071  acyl-CoA synthetase  37.75 
 
 
550 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0024  acyl-CoA synthetase  37.55 
 
 
544 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4191  acyl-CoA synthetase  37.68 
 
 
550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 
548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3533  acyl-CoA synthetase  37.11 
 
 
546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.8024  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.3 
 
 
569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3713  acyl-CoA synthetase  37.85 
 
 
550 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
547 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0180  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  36.1 
 
 
554 aa  306  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
548 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05602  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 
569 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0509  acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1394  acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592914  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1076  acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.3 
 
 
547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0993  acyl-CoA synthetase  38.22 
 
 
553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.936979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2306  acyl-CoA synthetase  38.22 
 
 
553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4540  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 
543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143365  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0193  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 
554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1474  acyl-CoA synthetase  38.22 
 
 
553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0138  acyl-CoA synthetase  38.22 
 
 
553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2782  acyl-CoA synthetase  38.57 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317959  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1686  acyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
553 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 
584 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1724  acyl-CoA synthetase  38.05 
 
 
556 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277595  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1570  acyl-CoA synthetase  37.57 
 
 
549 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>