More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2680 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2680  inner-membrane translocator  100 
 
 		 672 aa  1295    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.94 
 
 		 603 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 603 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 603 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 603 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0096  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.89 
 
 		 607 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 321 aa  174  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  32 
 
 		 456 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  33.02 
 
 		 305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 301 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.16 
 
 		 656 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 292 aa  140  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0586  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3005  inner-membrane translocator  36 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 301 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.94 
 
 		 304 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 304 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1470  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 322 aa  137  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 300 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 311 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 302 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 407 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 463 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0568  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 304 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 304 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 302 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 308 aa  132  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 301 aa  132  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 308 aa  132  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 		 293 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 301 aa  132  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 304 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 301 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 		 291 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 304 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 302 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.12 
 
 		 463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  32.9 
 
 		 304 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 307 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 307 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 302 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 293 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 304 aa  128  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 301 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 293 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2249  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 305 aa  127  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.749308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 305 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.39 
 
 		 316 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 319 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5538  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 320 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 316 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 308 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  36.78 
 
 		 593 aa  124  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.4 
 
 		 593 aa  124  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 290 aa  124  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 302 aa  123  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50530  branched-chain amino acid transport protein BraD  31.25 
 
 		 307 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 460 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 311 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  30 
 
 		 309 aa  123  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  29.4 
 
 		 398 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.07 
 
 		 292 aa  123  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 443 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 309 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 303 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4304  branched-chain amino acid transport protein BraD  30.94 
 
 		 307 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.1 
 
 		 316 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.43 
 
 		 316 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.71 
 
 		 316 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.71 
 
 		 316 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 338 aa  121  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  30.12 
 
 		 300 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4330  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 305 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.06779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 307 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.45 
 
 		 418 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 300 aa  120  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 294 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5396  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 304 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 320 aa  120  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 308 aa  120  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.09 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3900  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>