84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0283 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0283  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  112  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0273  50S ribosomal protein L30  64.41 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0832356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  42.11 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  35.59 
 
 		 59 aa  48.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  37.93 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  45.61 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  35.09 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  36.21 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  36.21 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  35.09 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  33.33 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  35.09 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32791  predicted protein  42.86 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108166 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  36.21 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  48.78 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  33.93 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  32.14 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  33.9 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  38.6 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 59 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  35.09 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  38.6 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  34.62 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  35.71 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  33.93 
 
 		 60 aa  41.2  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3977  ribosomal protein L30  35.09 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>