More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2350 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2350  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
423 aa  881    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2332  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  65.58 
 
 
404 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00680217  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3021  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  68.68 
 
 
394 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2390  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  65.52 
 
 
407 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144786  hitchhiker  0.00000571481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.76 
 
 
403 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1194  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.29 
 
 
383 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325962  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0551  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.34 
 
 
383 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0374112  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1321  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.48 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0344454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3855  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.56 
 
 
414 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3785  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.78 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.23 
 
 
425 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2870  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.16 
 
 
382 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0237  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.16 
 
 
382 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01942  VioA, involved in dTDP-N-acetylviosamine synthesis  36.54 
 
 
370 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.423599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01931  hypothetical protein  36.54 
 
 
370 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.572113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0937  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.84 
 
 
365 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5236  aminotransferase DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  36.61 
 
 
381 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00401376  normal  0.448242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2519  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.29 
 
 
386 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1920  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  37.74 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3211  aminotransferase  38.44 
 
 
376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.647908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2877  aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0095  aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.325267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3098  aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3956  aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0219  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.53 
 
 
380 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3874  aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3452  aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00530807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1667  aminotransferase  37.5 
 
 
382 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3439  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  37.97 
 
 
373 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0224902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2773  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.36 
 
 
360 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1583  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.81 
 
 
374 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2596  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.48 
 
 
366 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.148633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00992  nucleotide sugar transaminase  38.61 
 
 
369 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.431545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06174  nucleotide sugar transaminase  38.61 
 
 
369 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.26 
 
 
373 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0236655  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3836  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.91 
 
 
385 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.040066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3719  putative transferase  38.21 
 
 
381 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0099  putative transferase  38.62 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4046  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.97 
 
 
360 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.565912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0766  putative transferase  36.07 
 
 
402 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4288  nucleotide sugar transaminase  36.02 
 
 
378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2568  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.78 
 
 
369 aa  235  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2572  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.22 
 
 
369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0129477  normal  0.660703 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0826  aminotransferase  33.81 
 
 
364 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3755  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.34 
 
 
373 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0323  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.34 
 
 
357 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4322  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.73 
 
 
392 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000943682  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.08 
 
 
391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.7 
 
 
363 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.52 
 
 
370 aa  204  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.98 
 
 
1023 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0777  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.03 
 
 
400 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3185  polysaccharide biosynthesis protein  31.94 
 
 
358 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.07 
 
 
365 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2552  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.81 
 
 
1003 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.24 
 
 
378 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.42 
 
 
372 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.42 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0837  glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.65 
 
 
433 aa  189  8e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.99 
 
 
372 aa  189  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1470  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.24 
 
 
376 aa  189  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.88 
 
 
507 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.6 
 
 
362 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  34.51 
 
 
368 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08620  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  32.17 
 
 
370 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  32.07 
 
 
591 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  32.07 
 
 
586 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  32.07 
 
 
586 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3206  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  31.07 
 
 
391 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.79 
 
 
371 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.98 
 
 
368 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.79 
 
 
371 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1141  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase enzyme  31.69 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  32.14 
 
 
591 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.69 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2204  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.52 
 
 
374 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.06 
 
 
368 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0132  glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.17 
 
 
362 aa  179  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000423389 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0427  glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.64 
 
 
374 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0732605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  28.39 
 
 
401 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.89 
 
 
393 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3012  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.35 
 
 
481 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7630  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.63 
 
 
373 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.51 
 
 
387 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.22 
 
 
387 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.297651  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.44 
 
 
364 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0502  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.98 
 
 
372 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.374086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2079  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  29.69 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.22 
 
 
362 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2262  pleiotropic regulatory protein  33.06 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.47 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0121  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.99 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  31.96 
 
 
364 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2233  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.23 
 
 
363 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.51 
 
 
371 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1683  glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.61 
 
 
369 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0415301 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.78 
 
 
406 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4015  UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  30.32 
 
 
379 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371945  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5180  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.64 
 
 
420 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2982  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.72 
 
 
387 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>