More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3439 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3439  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  100 
 
 
373 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0224902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  86.83 
 
 
373 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0236655  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2596  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.72 
 
 
366 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.148633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2773  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.28 
 
 
360 aa  349  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4046  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.88 
 
 
360 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.565912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2572  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.98 
 
 
369 aa  335  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0129477  normal  0.660703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0323  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.69 
 
 
357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4288  nucleotide sugar transaminase  45.73 
 
 
378 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3185  polysaccharide biosynthesis protein  43.3 
 
 
358 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3785  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.77 
 
 
425 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1321  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.46 
 
 
369 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0344454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3211  aminotransferase  43.18 
 
 
376 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.647908  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3855  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.58 
 
 
414 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.49 
 
 
425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2519  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.82 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3452  aminotransferase  43.47 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00530807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3874  aminotransferase  43.47 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2877  aminotransferase  43.47 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0095  aminotransferase  43.47 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.325267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3098  aminotransferase  43.47 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1667  aminotransferase  43.47 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3956  aminotransferase  43.47 
 
 
382 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1920  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  44.13 
 
 
372 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1194  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.65 
 
 
383 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325962  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0766  putative transferase  40.05 
 
 
402 aa  271  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1583  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.78 
 
 
374 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2870  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.27 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0237  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.27 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2568  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.53 
 
 
369 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01942  VioA, involved in dTDP-N-acetylviosamine synthesis  40.61 
 
 
370 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.423599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01931  hypothetical protein  40.61 
 
 
370 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.572113  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00992  nucleotide sugar transaminase  41.44 
 
 
369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.431545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06174  nucleotide sugar transaminase  41.44 
 
 
369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5236  aminotransferase DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  39.73 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00401376  normal  0.448242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0219  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.5 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0099  putative transferase  42.12 
 
 
381 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3836  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.83 
 
 
385 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.040066  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3021  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  37.39 
 
 
394 aa  259  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2332  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.54 
 
 
404 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00680217  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3755  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.23 
 
 
373 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3719  putative transferase  41.83 
 
 
381 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0937  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.09 
 
 
365 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2390  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.82 
 
 
407 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144786  hitchhiker  0.00000571481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2350  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.97 
 
 
423 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0551  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.8 
 
 
383 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0374112  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0826  aminotransferase  36.13 
 
 
364 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.47 
 
 
403 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.45 
 
 
370 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.73 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.86 
 
 
378 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.95 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.1 
 
 
364 aa  173  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.67 
 
 
365 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.83 
 
 
364 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.02 
 
 
368 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.09 
 
 
362 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.66 
 
 
391 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.73 
 
 
363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0356  glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.43 
 
 
371 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.63 
 
 
366 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1237  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.39 
 
 
369 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  28.87 
 
 
367 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1470  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.9 
 
 
376 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  30.97 
 
 
368 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.7 
 
 
368 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0229  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.31 
 
 
389 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00533175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.04 
 
 
724 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0890  nucleotide-sugar aminotransferase  34.17 
 
 
369 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0663  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.06 
 
 
374 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.240838  normal  0.431325 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1125  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  35 
 
 
369 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.54 
 
 
387 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0280  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.53 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.97 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  27.62 
 
 
401 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0502  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.81 
 
 
372 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.374086  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  30.72 
 
 
586 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  30.72 
 
 
591 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.05 
 
 
1023 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0362  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.39 
 
 
392 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350885  normal  0.854352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  30.72 
 
 
586 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4196  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.83 
 
 
387 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1770  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.9 
 
 
387 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0427  glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.53 
 
 
374 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0732605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3206  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  30.25 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  29.68 
 
 
364 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.94 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.297651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  30.14 
 
 
591 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  27.93 
 
 
360 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.95 
 
 
373 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1141  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase enzyme  29.91 
 
 
379 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0777  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.94 
 
 
400 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2233  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.14 
 
 
363 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1410  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.81 
 
 
392 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1734  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.65 
 
 
371 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.57 
 
 
383 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.57 
 
 
383 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0533  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  28.69 
 
 
357 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1138  pigmentation and extracellular proteinase regulator  31.04 
 
 
384 aa  150  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.65 
 
 
372 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1860  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.72 
 
 
362 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>