More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3755 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3755  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
373 aa  763    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3836  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  64.74 
 
 
385 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.040066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0099  putative transferase  64.74 
 
 
381 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5236  aminotransferase DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  62.81 
 
 
381 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00401376  normal  0.448242 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2877  aminotransferase  62.13 
 
 
382 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0095  aminotransferase  62.13 
 
 
382 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.325267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3874  aminotransferase  62.13 
 
 
382 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771266  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3098  aminotransferase  62.13 
 
 
382 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4288  nucleotide sugar transaminase  62.73 
 
 
378 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1667  aminotransferase  62.13 
 
 
382 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3719  putative transferase  63.36 
 
 
381 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0219  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  63.64 
 
 
380 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3956  aminotransferase  62.13 
 
 
382 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3452  aminotransferase  62.13 
 
 
382 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00530807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2870  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  62.94 
 
 
382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0237  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  62.94 
 
 
382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3855  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  61.52 
 
 
414 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0766  putative transferase  61.43 
 
 
402 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3785  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  62.09 
 
 
425 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  62.09 
 
 
425 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00992  nucleotide sugar transaminase  60.33 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.431545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06174  nucleotide sugar transaminase  60.33 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1920  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  61.31 
 
 
372 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1321  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  59.78 
 
 
369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0344454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01942  VioA, involved in dTDP-N-acetylviosamine synthesis  58.01 
 
 
370 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.423599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01931  hypothetical protein  58.01 
 
 
370 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.572113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3211  aminotransferase  56.32 
 
 
376 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.647908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1583  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  58.29 
 
 
374 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2519  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  58.29 
 
 
386 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2568  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  58.07 
 
 
369 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1194  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.3 
 
 
383 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325962  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0551  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.7 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0374112  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0937  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.46 
 
 
365 aa  308  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4046  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.84 
 
 
360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.565912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2596  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.02 
 
 
366 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.148633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.23 
 
 
373 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0236655  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2773  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.99 
 
 
360 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2572  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.56 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0129477  normal  0.660703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3021  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  39.46 
 
 
394 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3439  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  41.23 
 
 
373 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0224902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2332  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.29 
 
 
404 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00680217  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0323  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.08 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2390  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.84 
 
 
407 aa  235  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144786  hitchhiker  0.00000571481 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0826  aminotransferase  35.64 
 
 
364 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3185  polysaccharide biosynthesis protein  37.82 
 
 
358 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2350  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.34 
 
 
423 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.18 
 
 
403 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.43 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.44 
 
 
362 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0229  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.63 
 
 
389 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00533175  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.91 
 
 
378 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.8 
 
 
391 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3545  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.94 
 
 
377 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1141  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase enzyme  32.87 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.42 
 
 
724 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  35.33 
 
 
368 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0440  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.59 
 
 
388 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.42883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.77 
 
 
389 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.57 
 
 
364 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0362  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.83 
 
 
392 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350885  normal  0.854352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.53 
 
 
366 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0434  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.72 
 
 
386 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.44 
 
 
365 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  35.94 
 
 
360 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1393  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.51 
 
 
392 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.24 
 
 
507 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0356  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.69 
 
 
371 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.07 
 
 
1023 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.3 
 
 
383 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.3 
 
 
383 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.96 
 
 
368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.11 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2511  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.79 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.59 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1770  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.72 
 
 
387 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3206  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  33.69 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  30.4 
 
 
367 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  35.78 
 
 
591 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  35.78 
 
 
586 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  35.78 
 
 
586 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1470  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.04 
 
 
376 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1483  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.52 
 
 
365 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2125  aminotransferase  34.87 
 
 
393 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.52 
 
 
372 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  35.03 
 
 
591 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.06 
 
 
379 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0427  glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.01 
 
 
374 aa  159  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0732605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1410  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.43 
 
 
392 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.9 
 
 
387 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  32.03 
 
 
364 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  31.35 
 
 
401 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5160  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.87 
 
 
404 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7630  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.53 
 
 
373 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2552  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.42 
 
 
1003 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1754  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.33 
 
 
368 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00293581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0240  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.66 
 
 
387 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  30.03 
 
 
367 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08620  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  32.18 
 
 
370 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.97 
 
 
362 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4493  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.43 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>