More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4046 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4046  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
360 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.565912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2773  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  56.9 
 
 
360 aa  421  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0323  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  55.34 
 
 
357 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2572  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.83 
 
 
369 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0129477  normal  0.660703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  49.86 
 
 
373 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0236655  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3439  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  47.88 
 
 
373 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0224902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3855  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.03 
 
 
414 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3785  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.8 
 
 
425 aa  328  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.25 
 
 
425 aa  322  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1321  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.41 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0344454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1920  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  43.61 
 
 
372 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2596  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.63 
 
 
366 aa  315  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.148633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2870  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.35 
 
 
382 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0237  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.35 
 
 
382 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5236  aminotransferase DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  41.27 
 
 
381 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00401376  normal  0.448242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1583  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.72 
 
 
374 aa  305  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01942  VioA, involved in dTDP-N-acetylviosamine synthesis  43.49 
 
 
370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.423599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01931  hypothetical protein  43.49 
 
 
370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.572113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3211  aminotransferase  42.38 
 
 
376 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.647908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4288  nucleotide sugar transaminase  41.83 
 
 
378 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1667  aminotransferase  42.11 
 
 
382 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2877  aminotransferase  42.11 
 
 
382 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3452  aminotransferase  42.11 
 
 
382 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00530807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0095  aminotransferase  42.11 
 
 
382 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.325267  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3956  aminotransferase  42.11 
 
 
382 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3874  aminotransferase  42.11 
 
 
382 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771266  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3098  aminotransferase  42.11 
 
 
382 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12825  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0826  aminotransferase  41.6 
 
 
364 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0219  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.44 
 
 
380 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3836  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.66 
 
 
385 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.040066  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2519  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.03 
 
 
386 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1194  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.05 
 
 
383 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325962  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00992  nucleotide sugar transaminase  40.77 
 
 
369 aa  293  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.431545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3755  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.84 
 
 
373 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06174  nucleotide sugar transaminase  40.77 
 
 
369 aa  293  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0937  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.34 
 
 
365 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0099  putative transferase  41.83 
 
 
381 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0766  putative transferase  40.66 
 
 
402 aa  289  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2568  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.38 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3719  putative transferase  41.27 
 
 
381 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0551  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.05 
 
 
383 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0374112  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3185  polysaccharide biosynthesis protein  40.45 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3021  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  40.7 
 
 
394 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2332  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.19 
 
 
404 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00680217  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2350  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.24 
 
 
423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2390  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.57 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144786  hitchhiker  0.00000571481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.1 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.71 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.18 
 
 
365 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.54 
 
 
362 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  33.43 
 
 
368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.78 
 
 
368 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.86 
 
 
1023 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.37 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7630  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.59 
 
 
373 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0362  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.55 
 
 
392 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350885  normal  0.854352 
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  26.67 
 
 
367 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1237  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.93 
 
 
369 aa  170  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0890  nucleotide-sugar aminotransferase  32.87 
 
 
369 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2552  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.46 
 
 
1003 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1125  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  32.87 
 
 
369 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.47 
 
 
372 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.5 
 
 
724 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.43 
 
 
372 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  28.57 
 
 
367 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  31.23 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.86 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0879  mannose-6-phosphate isomerase  34.62 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  30.9 
 
 
591 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  30.9 
 
 
586 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  31.1 
 
 
586 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.09 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.09 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.69 
 
 
368 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2810  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.85 
 
 
380 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.33 
 
 
382 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.93 
 
 
367 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.46 
 
 
389 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  31.4 
 
 
591 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1257  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.52 
 
 
364 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0777  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.53 
 
 
400 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0540  thioesterase family protein  34.56 
 
 
362 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.23 
 
 
507 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.34 
 
 
391 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3206  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  29.1 
 
 
391 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.44 
 
 
364 aa  159  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1470  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.48 
 
 
376 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1770  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.58 
 
 
387 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.154747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3108  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  32.2 
 
 
388 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.787533  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2142  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.06 
 
 
362 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4504  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.73 
 
 
382 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4589  PLP-dependent aminotransferase, UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose--oxoglutarate aminotransferase  30.91 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202203  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1483  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.16 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1410  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.71 
 
 
392 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.72 
 
 
406 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2351  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.07 
 
 
366 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.81 
 
 
371 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.81 
 
 
371 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  29.43 
 
 
375 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0509  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  30.42 
 
 
379 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>