More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0323 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0323  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
357 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4046  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  55.34 
 
 
360 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.565912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2773  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  55.31 
 
 
360 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2572  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.11 
 
 
369 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0129477  normal  0.660703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.04 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0236655  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3439  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  47.69 
 
 
373 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0224902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2596  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.21 
 
 
366 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.148633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3855  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.78 
 
 
414 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1321  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.7 
 
 
369 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0344454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3785  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.17 
 
 
425 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.413476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1920  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  39.23 
 
 
372 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4288  nucleotide sugar transaminase  39.89 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.61 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.993569  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2870  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.34 
 
 
382 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0237  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.34 
 
 
382 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2877  aminotransferase  40.22 
 
 
382 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0095  aminotransferase  40.22 
 
 
382 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.325267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3452  aminotransferase  40.22 
 
 
382 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00530807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3874  aminotransferase  40.22 
 
 
382 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771266  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1667  aminotransferase  40.22 
 
 
382 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481057  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3098  aminotransferase  40.22 
 
 
382 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1583  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.58 
 
 
374 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3956  aminotransferase  40.22 
 
 
382 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5236  aminotransferase DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  40.06 
 
 
381 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00401376  normal  0.448242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1194  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.67 
 
 
383 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325962  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01942  VioA, involved in dTDP-N-acetylviosamine synthesis  41.71 
 
 
370 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.423599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01931  hypothetical protein  41.71 
 
 
370 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.572113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0766  putative transferase  39.45 
 
 
402 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0937  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.46 
 
 
365 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00992  nucleotide sugar transaminase  38.23 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.431545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06174  nucleotide sugar transaminase  38.23 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0219  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.74 
 
 
380 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0826  aminotransferase  40.98 
 
 
364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3719  putative transferase  40.06 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2568  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.72 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3211  aminotransferase  37.02 
 
 
376 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.647908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2519  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.5 
 
 
386 aa  252  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3836  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.78 
 
 
385 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.040066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0099  putative transferase  38.57 
 
 
381 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3755  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.08 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3185  polysaccharide biosynthesis protein  39 
 
 
358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0551  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.14 
 
 
383 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0374112  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2332  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.38 
 
 
404 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00680217  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3021  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  36.52 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2350  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.34 
 
 
423 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2390  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.04 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144786  hitchhiker  0.00000571481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.85 
 
 
403 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.53 
 
 
370 aa  170  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0245  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.77 
 
 
357 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.4037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.28 
 
 
362 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0540  thioesterase family protein  35.87 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.89 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0146  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.09 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  32.45 
 
 
401 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1237  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.34 
 
 
369 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.55 
 
 
365 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1506  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.8 
 
 
535 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.54 
 
 
372 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1410  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.89 
 
 
392 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  33.72 
 
 
364 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0879  mannose-6-phosphate isomerase  32.13 
 
 
359 aa  156  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0502  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.47 
 
 
372 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.374086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1929  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.53 
 
 
362 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0280  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.34 
 
 
375 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  26.7 
 
 
367 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0824  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.22 
 
 
359 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  30.15 
 
 
368 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0427  glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.23 
 
 
374 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0732605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0952  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.62 
 
 
366 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  28.69 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.03 
 
 
389 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5774  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.48 
 
 
369 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1039  glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.99 
 
 
394 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000569321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1375  hypothetical protein  33.73 
 
 
371 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0509  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  30.81 
 
 
379 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1141  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase enzyme  27.92 
 
 
379 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  33.47 
 
 
586 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  33.47 
 
 
586 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3018  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.62 
 
 
518 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  33.47 
 
 
591 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5139  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.41 
 
 
391 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2511  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.07 
 
 
393 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1379  hypothetical protein  33.73 
 
 
371 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.75 
 
 
372 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0890  nucleotide-sugar aminotransferase  33.76 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1125  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  33.76 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  30.3 
 
 
591 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.56 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.49 
 
 
366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3093  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.06 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0616  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.08 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6578  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.93 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.15 
 
 
373 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.36 
 
 
724 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3206  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  29.89 
 
 
391 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.23 
 
 
368 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0902  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.43 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.754619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0777  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.7 
 
 
400 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  27.4 
 
 
372 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4762  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.59 
 
 
383 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000017153  normal  0.0991066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>