More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2970 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  100 
 
 
364 aa  765    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  66.2 
 
 
365 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  68.8 
 
 
362 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  67.67 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  65.56 
 
 
368 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  65.28 
 
 
368 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  60 
 
 
372 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  54.67 
 
 
367 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  52.63 
 
 
367 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.08 
 
 
367 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.69 
 
 
507 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.28 
 
 
371 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.28 
 
 
371 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.66 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.44 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.75 
 
 
371 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.77 
 
 
368 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.96 
 
 
374 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  38.76 
 
 
591 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  38.76 
 
 
586 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  38.76 
 
 
586 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  38.2 
 
 
591 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.25 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0525  aminotransferase  48.99 
 
 
255 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.28 
 
 
383 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.28 
 
 
383 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.7 
 
 
392 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.9 
 
 
370 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.09 
 
 
370 aa  259  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.22 
 
 
389 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.39 
 
 
373 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.3 
 
 
402 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.88 
 
 
383 aa  256  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  38.12 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4504  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.64 
 
 
382 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.8 
 
 
382 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.15 
 
 
390 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.53 
 
 
382 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.45 
 
 
380 aa  248  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  38.32 
 
 
360 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.72 
 
 
382 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.98 
 
 
369 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1135  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.18 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.91 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.2 
 
 
377 aa  242  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.36 
 
 
391 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  37.18 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.07 
 
 
372 aa  239  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  35.65 
 
 
383 aa  239  5e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.13 
 
 
363 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0828  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.63 
 
 
365 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  36.09 
 
 
368 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0502  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.14 
 
 
372 aa  235  8e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.374086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  35.36 
 
 
363 aa  235  9e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.39 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.44 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1141  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase enzyme  35.11 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1834  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.02 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272611  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.82 
 
 
357 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0427  glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.85 
 
 
374 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0732605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0874  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.97 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.41 
 
 
379 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  34.91 
 
 
384 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.97 
 
 
395 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  34.89 
 
 
365 aa  231  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.05 
 
 
398 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.2 
 
 
384 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  33.6 
 
 
500 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  33.88 
 
 
500 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.62 
 
 
381 aa  229  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  34.18 
 
 
364 aa  229  8e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  36.68 
 
 
401 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.63 
 
 
399 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3300  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.37 
 
 
394 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  33.61 
 
 
363 aa  226  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0229  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.78 
 
 
389 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00533175  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1120  polysaccharide biosynthesis protein  35.19 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0895  perosamine synthetase  35.19 
 
 
384 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.03 
 
 
406 aa  226  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2142  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.89 
 
 
362 aa  225  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.2 
 
 
364 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.88 
 
 
403 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.62 
 
 
375 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  34.44 
 
 
385 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.39 
 
 
403 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.26 
 
 
389 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  37.81 
 
 
365 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4033  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.44 
 
 
379 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0364  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.69 
 
 
383 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.34 
 
 
362 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.33 
 
 
383 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  33.79 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0346  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.95 
 
 
383 aa  222  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0190  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.77 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.6 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.98 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1458  pleiotropic regulatory protein, putative  38.12 
 
 
369 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0509  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  33.42 
 
 
379 aa  220  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0121  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.02 
 
 
358 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5668  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.06 
 
 
385 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.01985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>