More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3048 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  80.54 
 
 
371 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
382 aa  796    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  79.23 
 
 
382 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  76.5 
 
 
369 aa  606  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  60.64 
 
 
384 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  55.61 
 
 
381 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  52.08 
 
 
500 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  52.08 
 
 
500 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.63 
 
 
375 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.01 
 
 
500 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.48 
 
 
372 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.94 
 
 
379 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  48.63 
 
 
365 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  50.68 
 
 
383 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  49.45 
 
 
363 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  48.36 
 
 
363 aa  358  6e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.34 
 
 
390 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  47.25 
 
 
364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.25 
 
 
377 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.13 
 
 
384 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  47.01 
 
 
386 aa  330  3e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  46.53 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  46.23 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  49.86 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  45.74 
 
 
386 aa  326  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  41.89 
 
 
368 aa  308  9e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.28 
 
 
381 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.6 
 
 
368 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.01 
 
 
391 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.96 
 
 
362 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.96 
 
 
368 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.62 
 
 
372 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.13 
 
 
389 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.49 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  34.11 
 
 
384 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  35.81 
 
 
367 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.69 
 
 
392 aa  235  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  37.53 
 
 
364 aa  235  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  35.79 
 
 
383 aa  235  9e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.4 
 
 
380 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.34 
 
 
507 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  37.64 
 
 
368 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.98 
 
 
381 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.28 
 
 
395 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.98 
 
 
381 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.83 
 
 
387 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.19 
 
 
403 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.82 
 
 
383 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.95 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  34.53 
 
 
367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.95 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.58 
 
 
372 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.16 
 
 
374 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.23 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.24 
 
 
370 aa  223  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.6 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  34.99 
 
 
385 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  34.65 
 
 
385 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.58 
 
 
402 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  34.86 
 
 
383 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.33 
 
 
393 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  34.46 
 
 
383 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.84 
 
 
382 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.15 
 
 
399 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.66 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.36 
 
 
383 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.43 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.05 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  33.87 
 
 
591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.31 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.81 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.91 
 
 
403 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.81 
 
 
383 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.81 
 
 
383 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  32.97 
 
 
591 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  32.97 
 
 
586 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  32.97 
 
 
586 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.74 
 
 
394 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0711  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  33.16 
 
 
388 aa  205  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.04 
 
 
391 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.04 
 
 
391 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  32.53 
 
 
398 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4166  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.23 
 
 
407 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  35.22 
 
 
407 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.6 
 
 
371 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1361  glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.63 
 
 
407 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248455  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.31 
 
 
370 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.51 
 
 
373 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1998  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.62 
 
 
389 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  33.89 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6219  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.98 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.96406  normal  0.0916209 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6415  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.8 
 
 
405 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1135  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.59 
 
 
361 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  33.43 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.8 
 
 
395 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.27 
 
 
382 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4504  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.16 
 
 
382 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.68 
 
 
366 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3035  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.06 
 
 
379 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3898  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.73 
 
 
388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>