More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1477 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1477  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
337 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4357  alcohol dehydrogenase  68.45 
 
 
337 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.642498 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2099  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.23 
 
 
343 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2397  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.24 
 
 
341 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0755319  decreased coverage  0.00145448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.02 
 
 
348 aa  321  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2351  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.94 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2398  alcohol dehydrogenase  57.94 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.818361  normal  0.171565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2392  alcohol dehydrogenase  57.65 
 
 
350 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138903  normal  0.0541679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2422  alcohol dehydrogenase  57.01 
 
 
343 aa  298  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3729  alcohol dehydrogenase  40.88 
 
 
329 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
332 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0899  putative NADPH:quinone oxidoreductase protein  41.52 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.504483  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1603  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.41 
 
 
331 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12390  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  53.25 
 
 
210 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
323 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6226  alcohol dehydrogenase  50.72 
 
 
152 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.74 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
322 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
324 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.46 
 
 
336 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.47 
 
 
332 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.69 
 
 
305 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.99 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.96 
 
 
326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.65 
 
 
331 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7251  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.97 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0231  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
320 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000570336  unclonable  8.70956e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.29 
 
 
327 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
335 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.86 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.23 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.07 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.64 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
353 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.03 
 
 
323 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.3 
 
 
326 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0216  putative zinc-binding oxidoreductase  33.91 
 
 
338 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.591526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
322 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.29 
 
 
334 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
326 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
334 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.96 
 
 
324 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.64 
 
 
334 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.46 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.36 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  31.42 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.31 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  37.07 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.26 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.77 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2411  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.24 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.52 
 
 
332 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  32.75 
 
 
319 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.96 
 
 
332 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.12 
 
 
328 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  30.61 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  33.82 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
323 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
322 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
335 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
325 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
328 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.84 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.51 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.65 
 
 
321 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3312  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
320 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2635  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.82 
 
 
322 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.98 
 
 
315 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.38 
 
 
334 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.9 
 
 
322 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.94 
 
 
331 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
331 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.38 
 
 
331 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
332 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  32.66 
 
 
328 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.67 
 
 
339 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
339 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3158  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.61 
 
 
338 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.13 
 
 
322 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.65 
 
 
307 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.62 
 
 
335 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  32.16 
 
 
324 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
335 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>